Discussion :

[pianetdi]

Bonjour,

Je cherche le moyen de faire fonctionner différent encodage d'un fichier dicom pour permettre de lire les métadonnées.
J'ai fait le test avec la fonction matlab dicominfo. Elle me dit qu'elle a un problème d'encodage pour mon fichier dicom. J'arrive à afficher mon image avec la fonction dicomread.
Je n'arrive pas avoir le problème sur le fichier encodage et dicominfo.

merci

[Jerome Briot]

Elle me dit qu'elle a un problème d'encodage pour mon fichier dicom.

Tu pourrais être plus précis ?
MATLAB retourne-t-il un message d'erreur ?
Sinon, que retourne DICOMINFO ?

[pianetdi]

Le problème est le suivant sur différent version matlab même la version 2009

Code :

Sélectionner tout - Visualiser dans une fenêtre à part

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>> info = dicominfo('J:\projet\brain_001.dcm')
??? Error using ==> C:\MATLAB6p1\toolbox\images\images\private\dicom_set_mmeta_encoding
Could not determine file encoding.
 
Error in ==> C:\MATLAB6p1\toolbox\images\images\dicominfo.m
On line 145  ==>         file = dicom_set_mmeta_encoding(file, info{file.Current_Message});

La fonction dicominfo permet de lire les métadonnées du fichier dicom comme exemple suivant:

Code :

Sélectionner tout - Visualiser dans une fenêtre à part

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info = dicominfo('CT-MONO2-16-ankle.dcm')
info = 
                       Filename: [1x47 char]
                    FileModDate: '24-Dec-2000 19:54:47'
                       FileSize: 525436
                         Format: 'DICOM'
                  FormatVersion: 3
                          Width: 512
                         Height: 512
                       BitDepth: 16
                      ColorType: 'grayscale'
                          .
                          .
                          .

[Jerome Briot]

Le fichier dicom est-il volumineux ?
Peux-tu l'attacher à un de tes messages en le mettant dans une archive zip ou rar ?

Ou bien, si tu l'a récupéré sur internet, donne nous l'url du site...

[pianetdi]

Voici deux fichiers : le premier le point dicom et le deuxième sont les métadatas que je souhaite récupérer dans matlab.

[Jean Dumoncel]

Salut,

de mon côté, la ligne :

Code :

Sélectionner tout - Visualiser dans une fenêtre à part

info = dicominfo('00065DCM.dcm')

ne renvoie pas d'erreur (sur un matlab r2007a)
c'etait bien dicominfo qui générait cette erreur? ou alors j'ai rien compris?

[pianetdi]

Il y a d'autre image qui pose problème sur ce site http://pubimage.hcuge.ch:8080/ pour cette méthode dicominfo

J'ai vérifier mes images, j'ai retrouvé celle qui pose problème:

Le message d'erreur est le suivant:

Code :

Sélectionner tout - Visualiser dans une fenêtre à part

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>> info = dicominfo('C:\Documents and Settings\HP_Propriétaire\Bureau\test\brain_001.dcm')
??? Error using ==> C:\MATLAB6p1\toolbox\images\images\private\dicom_set_mmeta_encoding
Could not determine file encoding.
 
Error in ==> C:\MATLAB6p1\toolbox\images\images\dicominfo.m
On line 145  ==>         file = dicom_set_mmeta_encoding(file, info{file.Current_Message});

[pianetdi]

Après de long recherche et analyse la fonction dicominfo fonctionne pour une version minimum de R2008b.
En utilisant, cette version nous pouvons être comforme à la norme dicom3 (partie 6).

Il est possible de travailler autrement dicom en utilisant le langage java avec le package open source dcm4che2 (site : dcm4che.com)

[Jerome Briot]

Il faut bien comprendre que DICOM n'est pas un format d'image mais une norme définissant le transfert des données médicales entre divers appareils.

Le rôle de chaque constructeur est de se conformer à cette norme... ce qui est globalement le cas... mais pas toujours

Les codes de lecture/écriture sont donc souvent imparfaits dû (entre autre) à cette limitation.