Discussion :

[Jasmine80]

module Bio::SeqIO

Code :

Sélectionner tout - Visualiser dans une fenêtre à part

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my $seq = Bio::PrimarySeq->new
(-seq =>'CTAGGAATTCCTTAATTCATTAGCTCTGACTGCAAAGCTCGGGCAATATGTTTTCTCAGT',
-primary_id => 'synopsis',
-molecule => 'dna');
 
$seq->is_circular = 1;

Can't modify non-lvalue subroutine call at Restriction_Analysis_is_circular.pl line 14.

Le problème vient de la ligne $seq->is_circular = 1, peut-on forcer la modification d'un objet? Merci,


A défaut de trouver mieux, j'écrase l'objet si je dois le modifier :

Code :

Sélectionner tout - Visualiser dans une fenêtre à part

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	my $seq = Bio::PrimarySeq->new
		(-seq =>$seq_seq,
		-primary_id => $seq_id);
	if ($is_circular == 1){
		$seq = Bio::PrimarySeq->new
		(-seq =>$seq_seq,
		-primary_id => $seq_id,
		-is_circular => 1);		
	}

Merci;

[50Nio]

Malheureusement/Heureusement il n'y a pas moyen !
Le modèle objet est conçu avec des accès privés, des accès publics.
Un modèle objet bien conçu te permet de faire tout ce que tu as besoin, mais t'empêche de mal utiliser l'objet (genre en accédant à des objets privés).

Peut-être que si tu changeais la valeur de is_circular au cours de la vie de ton objet, tes résultats seraient incohérents. Pour empêcher un tel changement, le mode est forcé à la création. => ta solution est donc la bonne, selon ton cas, tu dois créer un objet différent.

[Jasmine80]

Merci pour ta réponse, c'est une fois de plus toi qui m'aide pour l'OO .