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Fonction taxa2dist : erreur "undefined columns selected"


Sujet :

R

  1. #1
    Membre actif Avatar de habasque
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    Par défaut Fonction taxa2dist : erreur "undefined columns selected"
    Bonjour,

    Je souhaite calculer des distances taxonomiques entre des espèces via la fonction taxa2dist (package Mass ou Vegan).

    Code : Sélectionner tout - Visualiser dans une fenêtre à part
    1
    2
     
    taxdis <- taxa2dist(sp.taxon, varstep=TRUE)
    Le contenu du dataframe sp.taxon est :

    Code : Sélectionner tout - Visualiser dans une fenêtre à part
    1
    2
    3
    4
     
                phylum  classe                        ordre    genre     famille
    Hipphipp mollusque Bivalve Euheterodonta_incertae_sedis Hippopus Tridacninae
    Tridmaxi mollusque Bivalve Euheterodonta_incertae_sedis Tridacna Tridacninae
    J'obtiens l'erreur suivante :

    Code : Sélectionner tout - Visualiser dans une fenêtre à part
    1
    2
     
    Erreur dans `[.data.frame`(x, , i) : undefined columns selected
    Si quelqu'un a une idée de l'origine de cette erreur...

    Merci d'avance

  2. #2
    Membre actif Avatar de habasque
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