Discussion :

[skystef]

Bonjour, malgré la lecture de tutoriels et de l'aide du logiciel R, je n'arrive pas à charger un fichier txt contenant des données formatées comme suit :

O 1 2 3
P1 23 5 45
P2 43 24 23

j'obtiens souvent le message :

Erreur dans scan(file, what, nmax, sep, dec, quote, skip, nlines, na.strings, :
la ligne 2 n'avait pas 2 éléments
+

[pitipoisson]

Bonjour,

Il nous faut un peu plus d'info pour pouvoir t'aider...
Quel type de séparateur dans le fichier texte ? espaces ? tabulations ?
Présence/absence d'en-tête de colonnes ?
Et surtout, les lignes de code qui t'ont données cette erreur ?
etc.

[W123sb]

Bonjour,
J'ai le même Pb que skystef (R n'arrive pas à lire des fichiers),
Dans mon cas J'ai 13 variables dans 13 colonnes et 107 observations (sites)
j'ai enregistré mon fichier excel dans texte (séparateur : tabulation),
R n'arrive pas à lire mon tableau j'ai ce message:

Code :

Sélectionner tout - Visualiser dans une fenêtre à part

Erreur dans scan(file, what, nmax, sep, dec, quote, skip, nlines, na.strings,  :   la ligne 2 n'avait pas 14 éléments

Merci pour votre aide
W123sb

[Ayest]

Bonjour,

Même remarque ptitpoisson. On ne peut pas aider si vous ne donnez pas la commande R que vous avez taper !
Donner :
1. les 5 premieres lignes du fichier de données
2. la commande R telle que vous l'avez tapée
Utiliser les balises CODE (cliquer sur le signe # qui est en haut de la fenetre d'edition) pour qu'on conserver le formattage de votre extrait de fichier.

Exemple :

Code :

Sélectionner tout - Visualiser dans une fenêtre à part

1
2
3
4
5
6
 
x y z
0.1 0.2 0.6
0.1 0.2 0.6
0.1 0.2 0.6
0.1 0.2 0.6

[W123sb]

Pardons je n'ai pas réusie à touve Utiliser les balises CODE je suis un débutant.

Mon tableau de nom "classeur" au départ sous excel 2007,

Code :

Sélectionner tout - Visualiser dans une fenêtre à part

1
2
3
4
5
A	CF	S	K 	F	T	PI	OI	FI	KI	
8	6	2	1,93	0,93	0,16	1,92	2,67	0	50	
10	7	3	2,01	0,87	0,17	2,08	3	50	68	
7	3	4	1,78	0,91	0,2	1,8	3	0	60	
9      5      4       2,06  0,94  0,14   1,78   3      0      61,11

je l'ai enregistré sous Texte(séparateur:tabulation) donc il devient "classeur.txt". je l'ai mis dans dans un répertoire Data-R et j'ai spécifié le chemin pour R.
j'ai rentré cette la commande

Code :

Sélectionner tout - Visualiser dans une fenêtre à part

1
2
> read.table("Classeur1.txt")
Erreur dans scan(file, what, nmax, sep, dec, quote, skip, nlines, na.strings,  :   la ligne 2 n'avait pas 14 éléments.

Merci pour votre aide
W123sb

[Ayest]

Essaie déjà ça : 'header' permet de spécifier que tu as une ligne de titre, et 'dec' spécifie que ton séparateur décimal est la virgule (au lieu du point)

Code :

Sélectionner tout - Visualiser dans une fenêtre à part

1
2
 
read.table("classeur.txt",header=TRUE,dec=",")

Ensuite, pour utiliser la balise CODE, il suffit d'ecrire CODE entre crochet au début de ce que tu veux écrire, puis /CODE entre crochet à la fin de ce que tu as écrit.

Edit : Tu parles d'un fichier "classeur.txt" et tu écris "Classeur1.txt" dans ta ligne de commande...

[pitipoisson]

Bonjour,

C'est normal, le séparateur par défaut de read.table n'est pas la tabulation, le nombre de colonne risque donc de ne pas coller... et même si c'était le cas, les données récupérées seraient fausses.

Soit tu passes les bonnes options :

Code :

Sélectionner tout - Visualiser dans une fenêtre à part

> read.table("classeur.txt", header=TRUE, dec=",", sep="\t")

soit tu utilise un profile prédéfini pour ton type de fichier :

Code :

Sélectionner tout - Visualiser dans une fenêtre à part

read.delim2("classeur.txt")

(ce sont des alias de read.table() avec des option prédéfinies, voir

Code :

Sélectionner tout - Visualiser dans une fenêtre à part

?read.table

)

Plus courant, c'est l'utilisation du format csv pour les données et l'usage des fonctions read.csv (locales "anglaises" prédéfinies : sep=",", dec=".") ou read.csv2 (locales françaises : sep=";", dec=",").

[W123sb]

Ca marche, j'ai suivie vos recommandations,
maintenant j'attaque la partie faire des ACP.

Merci pour votre aide.
W123sb