Discussion :

[larimoise]

Salut,
je cherche à utiliser un algorithme de correction du biais qui existe dans la bibliothèque itk: http://www.itk.org/Doxygen/html/itkM...Filter_8h.html
Mon problème, est comment le faire, dois je installer la bibliothèque pour pouvoir utiliser ce filtre et si oui comment l'utiliser? ou bien je peux prendre le fichier et l'incorporer à un programme Builder avec include.
Mes connaissances en builder sont assez limité.
Cette bibliothèque existe aussi sous Matlab (Matitk), mais je n y ai pas trouvé la partie correction du biais.
Je travaille sous windows.Toute aide me seras utile.
Merci d'avance

[Matthieu Brucher]

A priori, c'est template, mais bon vu l'architecture d'ITK, ça va être dur de ne prendre qu'un seul fichier.
Le plus simple, tu crées un wrapper au-dessus de ta classe image compatible avec l'interface des plug-ins d'ITK ou tu transformes ton image en image ITK, tu passes dans le filtre et tu récupères le résultat.

[larimoise]

Salut,

Milles a dit :

ou tu transformes ton image en image ITK, tu passes dans le filtre et tu récupères le résultat.

Obtenir mon image corrigée, me suffira. Maintenant comment transformer mon image en image itk? J'ai téléchargé itk mais je n'ai pas trouver un fichier d'installation? Je ne sais vraiment pas comment l'utiliser.
Si tu pouvais m'orienter.
J'ai déjà utilisé un autre logiciel qui fait la correction du biais mais c'était une application exécutable. Mais pour itk?

Merci

[Matthieu Brucher]

Installation avec cmake + compilation.
Après, je ne sais pas exactement comment faire pour créer ton image, il te faut regarder un peu dans les tutos...

[khayyam90]

Pour récupérer ton image dans itk, deux possibilités :
tu enregistres ton image dans un format qu'itk saura relire (png?), tu la charges dans itk, tu la traites, et tu la réenregistres dans un format que ton programme saura lire. Cette méthode nécessite deux programmes à appeler l'un après l'autre, ce n'est peut-être pas ce que tu veux.

Pour l'autre méthode, citée par Miles, tu devras copier ton image pixel à pixel dans un conteneur itk::image<pixelType, Dimension> propre à itk. La fonction setPixel(index, valeur) sera ton amie. Et ensuite pour récupérer les données dans ton traitement, tu fais l'opération inverse avec la petite soeur pixel getPixel(index)

[millie]

je cherche à utiliser un algorithme de correction du biais

Juste une petite question. Pour quelle application voulais tu te servir de cet algorithme ?

[larimoise]

Milles a dit:

Installation avec cmake + compilation.

mais avant d'utiliser cmake, que dois je avoir dans mon pc le c++ ? pour l'instant j'ai le c++ builder.
Est ce sous windows ou linux? parce que j'ai déjà essayé avant en lisant le tutorial mais je n'ai pas bien compris.
Si c'est sous linux, je n'y connais rien.
Millie à dit:

Juste une petite question. Pour quelle application voulais tu te servir de cet algorithme ?

Je veux l'utiliser pour corriger le biais d'une image IRM

Merci de votre aide

[Matthieu Brucher]

cmake est normalement capable d'utiliser C++ builder.

[stranger]

Sur le site d'ITK ils expliquent comment faire pour installer la biblio, sur ce lien en particulier : http://www.itk.org/ItkSoftwareGuide.pdf
Personellement je n'ai jammais essayer d'installer ITK, (j'ai eu la chance de l'avoir déja d'installer sur mon ordi) mais je pense qu'en suivant les étapes
d'installations qu'il te precise dans le ItkSoftwareGuide tu réussira à l'installer .

[larimoise]

Salut,

Sur le site d'ITK ils expliquent comment faire pour installer la biblio, sur ce lien en particulier : http://www.itk.org/ItkSoftwareGuide.pdf
Personellement je n'ai jammais essayer d'installer ITK, (j'ai eu la chance de l'avoir déja d'installer sur mon ordi) mais je pense qu'en suivant les étapes
d'installations qu'il te precise dans le ItkSoftwareGuide tu réussira à l'installer .

J'ai essayé de suivre les étapes, j'ai téléchargé cmake, je l'ai installé et j'ai essayé de compiler itk. Il me demande le chemin du code source et ou l'installer, j'ai suivi les étapes configurer puis ok.
En principe itk sera installé dans program files, ç'a s'exécute normalement, puisque je n'ai pas de message d'erreur . Mais je ne trouve pas le dossier dans program files.

[millie]

Mais je ne trouve pas le dossier dans program files.

En rangeant les dossiers par ordre de Dernier changement (clic droit et tout ça), le dernier dossier devrait correspondre

[larimoise]

Millie a écrit:
En rangeant les dossiers par ordre de Dernier changement (clic droit et tout ça), le dernier dossier devrait correspondre

Non le dossier n'y était pas. J'ai relancer cmake, j'ai donné le chemin pour le code source et j'ai changé le chemin (Where to build binairies) pour c:/program files/itk.
Et j'ai laissé le chemin (CMAKE_INSTALL_PREFIX) choisi automatiquement c:/program files/itk. Et j'ai cliqué sur configure puis ok.
J'ai un dossier ITK dans program files, mais il n'y a aucune icône pour lancer l'application, et j'ai remarqué que le dossier bin était vide.
Et je pense qu'en principe je dois trouver l'application dans le menu démarrer, si quelqu'un peut me confirmer?
Je met en PJ l'image de CMake telle que je l'ai configuré

Merci

[stranger]

Non le dossier n'y était pas. J'ai relancer cmake, j'ai donné le chemin pour le code source et j'ai changé le chemin (Where to build binairies) pour c:/program files/itk.
Et j'ai laissé le chemin (CMAKE_INSTALL_PREFIX) choisi automatiquement c:/program files/itk. Et j'ai cliqué sur configure puis ok.
J'ai un dossier ITK dans program files, mais il n'y a aucune icône pour lancer l'application, et j'ai remarqué que le dossier bin était vide.
Et je pense qu'en principe je dois trouver l'application dans le menu démarrer, si quelqu'un peut me confirmer?
Je met en PJ l'image de CMake telle que je l'ai configuré

Merci

Desolé moi je pourrai pas t'aider puisque je n'ai jammais essayer de l'installer via le guide d'Itk (en plus on me l'a installé sous Linux donc ...). Regarde ici dans la FAQ d'itk: http://www.itk.org/Wiki/Itk_FAQ
Peut etre que tu trouvera une reponse à ton probleme. C'est tout ce que je peu faire pour t'aider,
Bon courage

[larimoise]

Merci stranger,

J'ai cherché dans la FAQ, il faut trouver un fichier ITK.sln ou ITK.dsw, je n'en ai trouvé aucun!
j'ai utilisé C++ builder pour la configuration, est ce que c'est ça le problème?

Je suis prête à tenter l'installation sous linux, avec un coup de main des linuxiens.

Merci de toute aide

[Matthieu Brucher]

Si tu prends C++ Builder comme paramètre, il ne va pas créer un projet pour Visual Studio, c'est logique !

[larimoise]

Milles a écrit :

cmake est normalement capable d'utiliser C++ builder.

et après:

Si tu prends C++ Builder comme paramètre, il ne va pas créer un projet pour Visual Studio, c'est logique !

Alors je n 'y comprends rien, désolé.
je ne sais pas ce que c'est visuel studio?

[Matthieu Brucher]

Visual studio, c'est le compilateur de Microsoft, et c'est pour lui les .dsw ou les .sln, donc pour l'instant, c'est surtout que je ne comprends pas ce que tu as et ce que tu veux faire.

[larimoise]

Salut,
désolé de ne pas parvenir à me faire comprendre
comme je l'ai dit avant je ne connais pas visual studio, mais en cherchant j'ai vu que c'est un environnement pour visual c++.
Pour ma part, je n'ai jamais utilisé visual c++, je ne connais que c++ builder (j'ai fait quelques applications pas trop compliquées), et je travaille surtout en Matlab.
D'aprés le itksoftwareguide
on doit installer makefile, et configurer en choisissant entre différents compilateur.
En lançant make file, pour la configuration j'ai choisi Borland makefiles, et apparament il n'ya pas eu de problème, j'ai un dossier itk dans program files et je joint à ce post l'image du contenu.
Mais la suite je ne sais pas quoi faire ......

[millie]

Ce post a été finalement déplacé le sous forum : Bibliothèque C++ dans lequel il aura une meilleure place.

Je l'avais initiallement laissé dans Traitement d'images car je m'attendais à ce qu'une alternative soit proposée (comme par exemple l'algorithmique du filtre de biais).

Millie

[larimoise]

Salut,

Merci millie

J'ai téléchargé borland 5.5 et je l'ai installé, mais je n'arrive toujours pas à installer la bibliothèque.
On m'a aussi conseillé de l'installer sous visual c++ plutôt que borland , le problème c'est que je ne l'ai jamais utilisé, mais s'il y' a des âmes charitables pour m'aider, je suis prête à tenter un essai.

merci