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Bioinformatique Perl Discussion :

requête Genbank et mise à jour


Sujet :

Bioinformatique Perl

  1. #1
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    Par défaut requête Genbank et mise à jour
    Bonjour,

    J'ai écrit un script qui interroge GenBank, y recherche des informations et les charge dans une base de données MySQL.
    Pourriez-vous me dire comment et quels modules utiliser afin de régulièrement refaire tourner ce script pour effectuer des mises à jours des informations contenues dans la base de données? Que les séquences non modifiées restent les mêmes mais que les changements puisse être remis à jour et les nouvelles séquences insérées.

    Merci,


    Jasmine,
    -- Jasmine --

  2. #2
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    Par défaut
    pour lancer ton script à des periodes reguliere, faut faire un cron.

    voilà

  3. #3
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    Par défaut
    tu as des outils qui font ça tels que
    BioMAJ

  4. #4
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    Par défaut
    Merci, je vais suivre vos conseils.
    J'espère que sous Windows il existe des fonctions similaires au cron.

    Jasmine,
    -- Jasmine --

  5. #5
    Responsable Perl et Outils

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    Par défaut
    le gestionnaire de tache dans panneau de conf (taches plannifiées)

    voilà

  6. #6
    Membre émérite
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    Merci beaucoup.
    -- Jasmine --

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