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R Discussion :

Changer l'echelle de l'axe Y dans un graphe dans R


Sujet :

R

  1. #1
    Nouveau Candidat au Club
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    Par défaut Changer l'echelle de l'axe Y dans un graphe dans R
    J'essaie de créer un graphe un peu plus élaboré avec GGPLOT mais pour je ne sais quelle raison l'inclinaison de ma corrélation n'est incorrect.
    Il s'agit du taux d' Acid Uric (UA) et par rapport au taux de Lysyl oxydase (une enzyme )

    Avec un code pour graph de base ça marche:
    Code : Sélectionner tout - Visualiser dans une fenêtre à part
    1
    2
    plot(lox1$UA, lox1$'LOX B', main = "correlation between Uric Acid and LOX" , xlab = "Uric acid", ylab= "LOX")
    abline(lm( lox1$'LOX B'~lox1$UA), col= "red")
    (ci-joint le 1er graph)

    avec le graph ggplot la corrélation est nulle ce qui est faux . Ci-joint le code en question et le graphe associé

    Code : Sélectionner tout - Visualiser dans une fenêtre à part
    1
    2
    3
    scatter_plot <- ggplot(lox1, aes(UA, 'LOX B'))
    scatter_plot + geom_jitter() + labs(x = "Uric Acid (mg/dL)", y = "Lysil Oxydase ") + geom_smooth(method="lm")
    +scale_y_continuous( breaks=5, labels, limits=c(0,15))+scale_x_continuous( breaks=5, labels, limits=c(0,15))
    En fait c'est comme si le programme ne tient pas du tout compte de mon code "scale_x_continous" ou "scale_y_continous"
    Que les variables soient sous forme numérique ou facteur n'améliore rien.
    Avez-vous une idée de mon erreur?
    Images attachées Images attachées   

  2. #2
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    Bonjour Lisa.
    Dans aes, les noms des variables ne doivent pas être entre guillemets. En l'occurrence {ggplot2} ne comprend pas que "LOX B" est le nom de ta colonne.
    Comme "LOX B" n'est pas un nom de colonne correcte, il y a deux solutions :
    Code : Sélectionner tout - Visualiser dans une fenêtre à part
    + aes_string("UA","LOX B")
    ou
    Dans le premier cas, aes_string permet de passer les noms de colonnes comme des textes. Dans le second, ce sont des backquotes (alt gr + 7 sous Windows) qui encadrent le nom "non standard".
    Bon courage.
    Olivier

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