Discussion :

[Oula33]

Bonjour,
Je suis débutante en python et je galère pas mal. Je n’aurais besoin qu’une portion de ligne entre deux balises. Soit supprimer tout ce qui est en dehors de ces deux balises et garder le fichier finale ou créer un nouveau fichier avec uniquement les lignes comprises entre les deux balises. Mais avant je voudrais mettre les lignes du fichier dans une liste.

J’ai consulté la fac et j’ai vu un problème pareil, mais quand j’essaye les codes ça ne marche pas.
Please help 🤯

Code :

Sélectionner tout - Visualiser dans une fenêtre à part

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fichier_in = open(sys.argv[1], 'r') 			 
fichier_out = open("fichier_out.txt", "w")  		
ligne = fichier_in.read()				
 
fichier_in.close()
 
lignes= ligne.split('\n')
 
for i in range(0, len(lignes), 1) :
	if lecture == 'Sequences producing significant alignments\n':
		while (lecture != 'ALIGNMENTS\n') :
			fichier_out.write(str(lecture + '\n'))
			lecture =(lignes.readline())
		fichier_out.write(str(lecture +'\n'))
	lecture = lignes.readline()	
fichier_out.close()

[VinsS]

Salut,

Repère les indexs de tes balises et enregistre ce qui se trouve entre les deux.
Par exemple:

Code :

Sélectionner tout - Visualiser dans une fenêtre à part

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with open(sys.argv[1], 'r') as inf:
    lines = inf.readlines()
 
start = lines.index("Sequences producing significant alignments\n")
if start == -1:
    # ligne non trouvée, traitement de l'erreur
 
end = lines.index("ALIGNMENTS\n")
if end == -1:
    # ligne non trouvée, traitement de l'erreur
 
txt = "".join(lines[start+1: end])
with open("fichier_out.txt", "w") as outf:
    outf.write(txt)

[Oula33]

super merci, ça marche.