Envoyé par
GLDavid
Bonjour
Pour avoir été bioinformaticien, je ne comprend pas ce point pour cette histoire.
Les bioinformaticiens passent leur temps aussi à stocker dans des bases de données des gènes, des protéines, des fonctions...
Excel, c'est le couteau suisse du biologiste. La plupart du temps, ils s'en servent pour faire des statistiques et du graphe. La culture informatique n'est pas si développé en biologie et vous seriez étonnés de voir les pratiques logicielles dans les labos, fussent-ils publics ou privés.
Bref, la bioinformatique, outre l'aspect recherche, essaie également de remédier à ces défauts en fournissant un panel d'outils et de bases de données afin d'aider le biologiste dans sa recherche (homologie de séquences ou de fonctions, réseaux) ou dans le workflow (scripts, logiciels). En bioinformatique, Excel n'est qu'un logiciel de visualisation de données.
Toujours est-il que de voir qu'une mauvaise utilisation logicielle impacte une convention de nommage de gènes me fait mal à ma biologie. On m'a toujours appris qu'un nom de gène, c'était en minuscule et italique, par exemple: sema3f. Donc, on nous demande de changer parce que l'enseignement informatique des outils de base est insuffisant? Cherchez l'erreur. En parlant bases de données génomiques et protéiques, devra t'on alors reprendre toutes les bases pour changer les noms de bases? Ca promet de belles heures de Data Management.
@++
Partager