Discussion :

[Julie19]

Bonjour,
J'ai un tableau que j'aimerais transformer en tableau d'occurrence sous R mais je peine à trouver les lignes de codes ...

J'ai tableau comme ceci :

Placette	Espèce	Fleur	Tige	Feuille	Racine
EP01	especeA	1	1	0	0
ED02	especeA	1	0	0	0
ED03	especeA	0	1	1	1
ED05	especeA	0	0	0	1
EP01	especeB	0	1	1	0
EI03	especeB	0	0	0	1

Et j'aimerais le transformer de la manière suivante :

Placette	Espece	Substrat
EP01	especeA	Fleur
EP01	especeA	Tige
ED02	especeA	Fleur
ED03	especeA	Tige
ED03	especeA	Feuille
ED03	especeA	Racine
...

Quand l'espèce est présente dans 3 substrats différents alors il y aura 3 lignes de l'espèce avec chacune un substrat.
Avez-vous des conseils à me donner ?
Je vous remercie !

[xavier-Pierre]

bonjour une solution possible avec le tidyverse

Code :

Sélectionner tout - Visualiser dans une fenêtre à part

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library(tidyverse)
## df étant ton dataframe j'ai changé les noms des colonnes placette et espece
 
df_resultat <- df %>% pivot_longer(-c(placette,espece),names_to = "substrat",values_to = "tempo") %>% 
    filter(tempo != 0) %>% select(- tempo)

je te souhaite une bonne journée

[Julie19]

Bonjour,
Merci beaucoup pour votre aide !

[tototode]

Bonjour,

La même chose avec la fonction reshape (fonction de base) :

Code :

Sélectionner tout - Visualiser dans une fenêtre à part

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tabl <- reshape(tab, idvar = c("Placette", "Espèce"), direction = "long", 
  varying = list(3:6), times = colnames(tab)[3:6])
tabl <- subset(tabl, Fleur > 0.5)
tabl <- tabl[, -ncol(tabl)]

cdlt