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R Discussion :

Souci pour séparer des données sur un histogramme


Sujet :

R

  1. #1
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    Par défaut Souci pour séparer des données sur un histogramme
    Bonjour !

    Voilà, je me suis remis à R après 2-3ans sans y toucher et j'ai découvert ggplot (quel magnifique outil). Seulement voilà, après 2 semaines à potasser les bases pour me remettre à niveau, j'ai beau écumer les sites et forums, impossible d'obtenir ce que je souhaite ! Explication ci-dessous...

    Voici mon tableau de données :
    Nom : image_ 1.PNG
Affichages : 150
Taille : 13,0 Ko

    A partir de ces données, j'aimerais faire un histogramme avec en abscisses les différents endos, et en ordonnées la surface indiquée avec, pour chaque endo, une barre CTRL et une barre PIF_50 côte à côte.
    Du coup, j'ai mis ce code :
    Nom : image_2.PNG
Affichages : 149
Taille : 14,1 Ko

    Et ça me donne ce graphique :
    Nom : image_3.PNG
Affichages : 157
Taille : 24,4 Ko

    Comme vous voyez, j'ai diminuer l'opacité pour qu'on puisse voir les deux bandes pour CTRL et pour PIF_50, seulement elles ne sont pas côte-à-côte, elles sont superposées ! J'ai essayé les fonctions "positions" et "position_dodge", j'ai tenté de mettre cette fonction sur chaque sous-ensemble geom mais rien à faire =/ Je ne comprends pas pourquoi mes bandes sont superposées.

    Une idée les gens ?

  2. #2
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    Par défaut
    Bonjour,

    le plus simple avec la librairie ggplot2 est d'avoir un tableau en format "long", avec une colonne pour les x, une pour les y et une autre pour la couleur :
    Code : Sélectionner tout - Visualiser dans une fenêtre à part
    1
    2
    3
    4
    5
    6
    library(tidyr)
    tabl <- pivot_longer(tab, c("CTRL", "PIF50"))
    ggplot(tabl, aes(x = endo, y = value, fill = name)) + 
      geom_histogram(position = "dodge2", stat = "identity") + 
      scale_fill_manual(values = c("CTRL" = "red", "PIF50" = "blue")) 
      # si tu veux enlever la légende : theme(legend.position = "none")
    Il y a pas mal de fonction pour passer d'un tableau en format large vers un tableau en format long, comme reshape, ou melt (library reshape2) ou gather (tidyr), etc.

    cdlt

  3. #3
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    Par défaut
    Bonjour !

    Merci, ça marche tout de suite beaucoup mieux ^^ Je suppose que mon tableau n'était pas suffisamment "tidy" pour ggplot =)

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