Discussion :

[judkil]

Hello,

Je galère un petit peu, j'aimerais savoir comment lire mon fichier d'extension .mat sur R.

J'ai fait un library("R.matlab") et un install.packages("R.matlab"), mais je n'arrive pas à utiliser la fonction readMat().


Est-ce comme ceci

Code :

Sélectionner tout - Visualiser dans une fenêtre à part

readMat(file="C:/Users/Public/descriptor_pocket.mat")

Cordialement

[faubry]

L'aide de la fonction readMat (qui s'obtient par ?readMat ou help( "readMat")) indique que le premier argument a pour nom con et qu'il peut contenir le pathname du fichier à lire. En outre, elle cette fonction n'a aucun argument de nom file.

[yo_mounette]

Bonjour,

essaie en mettant library("Rmatlab") juste avant readmatlab.

j'ai souvent ce problème, en installant des package des fonction qui ne fonctionne pas mais j'ai reussi a resoudre ça avec cette astuce. Je ne sais pas si ça va marcher dans ton cas mais fait le test.

Code :

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library("R.matlab")
readMat(file="C:/Users/Public/descriptor_pocket.mat")

A dispo.

Hello,

Je galère un petit peu, j'aimerais savoir comment lire mon fichier d'extension .mat sur R.

J'ai fait un library("R.matlab") et un install.packages("R.matlab"), mais je n'arrive pas à utiliser la fonction readMat().


Est-ce comme ceci

Code :

Sélectionner tout - Visualiser dans une fenêtre à part

readMat(file="C:/Users/Public/descriptor_pocket.mat")

Cordialement

[faubry]

yo_mounette écrit

essaie en mettant library("Rmatlab") juste avant readmatlab.

j'ai souvent ce problème, en installant des package des fonction qui ne fonctionne pas mais j'ai reussi a resoudre ça avec cette astuce. Je ne sais pas si ça va marcher dans ton cas mais fait le test.

Ce n'est pas une astuce mais une obligation. En effet, la fonction install.packages importe le package (c'est-à-dire sa description, son aide, le source, etc. donc tout ce qui est nécessaire pour pouvoir l'utiliser) sur le disque dur dans un répertoire qui est par défaut library dans le répertoire d'installation de R. Il peut être différent, cf. la fonction .libPaths. A ce moment, les fonctions du package ne sont pas directement accessible depuis R. Il faut pour cela que le package soit chargé en mémoire et attaché à l'espace de travail (cf. la fonction search) pour être accessible depuis l'espace de travail. Cette opération est effectuée par la fonction library ou la fonction require.

Pour résumer :
1) install.packages est à effectuer une seule fois pour charger le package sur disque ; update.packages permet les mises à jour des packages chargés sur le disque.
2) à l'ouverture de chaque session de R et avant utilisation des fonctions du package, il faut attacher le package à l'espace de travail par appel à library ou à require. Cette opération ne se fait qu'une fois par session.

Enfin, comme je l'ai signalé, la fonction readMat n'a aucun argument de nom file. Son premier argument s'appelle con (pour connection) et peut être une chaine de caractères qui sera alors interprétée comme le pathname du fichier à lire. Puisque c'est le premier argument et qu'il est obligatoire, son nom peut être omis. Le code est donc :

Code :

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# début de session
library( R.matlab)
 
...
 
# lecture du fichier .mat - les données du fichier sont récupérables dans la liste reférencée par la variable donnees
donnees <- readMat( "C:/Users/Public/descriptor_pocket.mat")
 
# sortie de la session
q()