Discussion :

[pitchu]

Bonjour,

J'utilise le package doParallel et j'ai une erreur que je n'arrive pas à résoudre. Avec %do% je n'ai pas cette erreur:

Code :

Sélectionner tout - Visualiser dans une fenêtre à part

1
2
3
4
5
6
7
8
9
10
11
12
13
14
 
library(doParallel)
 
fun <- function(n, p) colMeans(matrix(runif(n*p), n, p))
args <- CJ(n = c(1e4, 1e5, 1e4), p = c(10, 50, 20))
 
cl <- makeCluster(9)
registerDoParallel(cl)
results <- foreach(i=1:nrow(args)) %dopar%
{
  return(fun(n = args[i]$n, p = args[i]$p))
}
Error in { : task 1 failed - "plage non numérique pour une matrice"
stopCluster(cl)

[tototode]

Bonjour,

probablement que le cluster que tu crées est un cluster a mémoire dédiée (type SOCK par exemple) et si tel est le cas il ne trouve pas l'objet args parce que tu ne l'as pas exporté au préalable. De même ensuite pour la fonction fun.
Il te faut faire clusterExport(cl, c("args", "fun")) avant la commande foreach et probablement aussi ajouté l'argument .packages = "data.table" dans la commande foreach ou alors créer args avec la fonction expand.grid.
cdlt

[pitchu]

bonjour,
merci de votre aide.