Discussion :

[loula05]

bonjour,

Je suis débutante sur R, j'essaie de lister tous les fichiers au format tif que j'ai dans un dossier afin de les visualiser.

J’ai réussi à le faire pour une fichier mais pas pour tous.

PS: j'ai installé les librairies raster, sp et rgdal, et MODIS (les fichiers que j'ai sont de type MODIS, ce sont des images satellitaire)

Merci de m'aider.

Voila mon script R :

Code :

Sélectionner tout - Visualiser dans une fenêtre à part

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library(raster)
library(rgdal)
library(tiff)
 
r <- raster("D:/Rprojet/MODIS/MOD13Q1.006__250m_16_days_EVI_doy2000209_aid0001.tif")
str_name<-'MOD13Q1.006__250m_16_days_EVI_doy2000209_aid0001.tif' 
imported_raster=raster(str_name)
plot (r)

ce script me permet d'importer et afficher une seul fichier alors que j'ai besoin de les afficher tous.

merci d'avance

[tototode]

Bonjour,

tu peux retrouver tous les fichiers d'un dossier en les filtrant selon leur extension via la fonction list.files.

Code :

Sélectionner tout - Visualiser dans une fenêtre à part

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l1 <- list.files("D:/Rprojet/MODIS/", patt = "\\.tif")
par(ask = TRUE)
for (i in l1) {
  plot(i)
}

Après avec ce code a chaque fois que tu vas charger une image on va te demander de valider pour représentée graphiquement le fichier puis tu passes à l'image suivante et tu écrases la précédente.
Il faut savoir ce que tu veux faire de chaque graphique.

cdlt

[loula05]

Bonjour;

merci beaucoup je vais le tester mais après avoir listé tous mes fichiers tif, j'aimerai les ploter, les visualiser tous en même temps dans la fenêtre plot du R, est-ce que je peux ? J'ai 53 fichiers ?

merci beaucoup

[loula05]

le script tourne mais affiche ce message je le comprend pas

Code :

Sélectionner tout - Visualiser dans une fenêtre à part

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> l1 <- list.files("D:/Rprojet/MODIS", patt = "\\.tif")
> par(ask = TRUE)
> for (i in l1) {
+   plot(i)
+ }
Hit <Return> to see next plot: 
Error in plot.window(...) : valeurs finies requises pour 'ylim'
In addition: Warning messages:
1: In xy.coords(x, y, xlabel, ylabel, log) : NAs introduced by coercion
2: In min(x) : no non-missing arguments to min; returning Inf
3: In max(x) : no non-missing arguments to max; returning -Inf
>

je dois ecrire quelque chose je pense ?

merci

[tototode]

re,

parce qu'il y a une erreur dans le script. Dans l1 tu as ne le nom des fichiers mais pas leur chemin complet :

Code :

Sélectionner tout - Visualiser dans une fenêtre à part

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l1 <- list.files("D:/Rprojet/MODIS/", patt = "\\.tif")
l1 <- sprintf("D:/Rprojet/MODIS/%s", l1)
 
par(ask = TRUE)
for (i in l1) {
  plot(i)
}

cdlt

[loula05]

Dans l1 j'ai mis le chemin complet vers le Dossier MODIS où il y a les fichiers tif, veuillez m'excuser est-ce que à la place de %s je mets le nom du fichier tif ou non ?

Je ne comprends pas ce qu'il veut dire par « return  »

Code :

Sélectionner tout - Visualiser dans une fenêtre à part

Hit <Return> to see next plot:

et quand je clique sur entrer il affiche l'erreur encore

[tototode]

excuse moi, c'est moi qui suis fatigué.
Il n'y a aucune commande dans ce que je t'ai donné qui importe le fichier ...

Code :

Sélectionner tout - Visualiser dans une fenêtre à part

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l1 <- list.files("D:/Rprojet/MODIS/", patt = "\\.tif")
l1 <- sprintf("D:/Rprojet/MODIS/%s", l1)
 
par(ask = TRUE)
for (i in l1) {
  r <- raster(i)
  plot(r)
}

cdlt

[loula05]

wow oui ça marche et à chaque fois que je clique sur entrer il plot le fichier tif suivant. Merci beaucoup

Est-ce qu'il est possible de les afficher tous en même temps ou c'est impossible ou par 5 ou 4 ; j'ai 53 fichiers tif ?

Je veux les utiliser afin d'extraire un indice EVI de végétation et créer des profils et les analyser !

Je m'excuse pour mon accent en français

merci

[tototode]

Tous en même temps ça ne rendra rien.
Si tu les veux 2*2 ou 4*4, tu remplaces la commande par(ask = TRUE) par par(ask = TRUE, mfrow = c(2,2)) ou par(ask = TRUE, mfrow = c(4,4)).
cdlt

[loula05]

oui merci beaucoup je viens de tester et ça marche .

j’aimerai savoir comment l’arrêter de lister les files je fais comment ?

je vais apprendre R car je suis débutante

bonne journée

svp j'eai besoin des tuto ou cours détaillé pour bien apprendre R

merci