Discussion :

[ptroy]

Bonjour
Je souhaite recoder plusieurs variables prises par R par défaut comme "numéric" alors que ce sont des "factors" de 0 ou de 1.
Je le fais pour une seule variable avec:

Code :

Sélectionner tout - Visualiser dans une fenêtre à part

> data$variable1<-as.factor(data$variable1)

et ça marche! Mais j'en ai 50 à faire comme ça!
J'essaie :

Code :

Sélectionner tout - Visualiser dans une fenêtre à part

>data[c(1:50)]<-as.factor(data[c(1:50)]

mais ça marche pas: R mets un "+" en invite de commande et je sais pas quoi en faire..
Alors avec le temps que j'ai déjà perdu à chercher comment faire pour la beauté du geste j'y serais déjà arrivé à l'heure qu'il est mais c'est une question de principe !
Je suis preneur de toute solution, alternative, explication!
Merci d'avance

[Alpacky]

R met un plus car il manque une parenthèse à la fin de votre ligne de code donc il attend la fermeture;
Afin de transformer plusieurs colonnes vous pouvez utiliser la fonction lapply(df, as.factor) qui appliquera la fonction as.factor à chaque colonne de df;

[ptroy]

Merci pour cette réponse
Effectivement pour la parenthèse: le truc c'est que quand je la mets et complète ma ligne, R recode ces variables en chr!....incompréhensible à mon niveau
Sinon lapply fonctionne très bien c'est vrai pour toutes les variables / colonnes du data.frame mais je souhaite ne l'appliquer qu'à certaines (et plusieurs) d’entre elles...

[Alpacky]

je pensais que vous auriez appliquer votre methode de sélection des colonnes....
voila un exemple

Code :

Sélectionner tout - Visualiser dans une fenêtre à part

1
2
3
 
test <- data.frame( a = c(0,1,1,0), b = c(0, 1, 0, 1), c = c(4, 3, 2, 1))
test[1:2] <- lapply(test[c("a","b")], as.factor)  # j'ai mis deux façons différentes d'appeler les mm col pour l'exemple

[ptroy]

Top!!
J'ai utilisé la 2ieme qui me semblait plus simple pour appliquer la fonction à de nombreuses variables qui se suivaient (genre de la 15ième à la 42ième)
pour cette fonction lapply je comprends pas le "l" pour lenght je sais mais bon..en même temps je m'y suis mis hier à R donc bon!!
D'ailleurs je me demande aussi pourquoi avec ma première syntaxe ca marchait pas et en plus ca me recoder les variables en chr...bref!!!
Encore merci

[Alpacky]

il y a beaucoup de bonnes ressources en ligne pour bien comprendre R et de nombreux moocs aussi! il y a un mm un package appelé swirl qui permet d'apprendre à se servir de R!

sinon pour lapply, je ne suis pas certain d'avoir compris votre question, mais si c'est pourquoi cela s'appelle 'l'apply c'est pour list-apply, un data.frame est un cas particulier de list (qui est un objet de R) (cf. help des fonctions apply)

pour comprendre pourquoi votre première syntaxe ne fonctionne pas vous pouvez regarder comment sont codées les fonctions as.factor et factor en les écrivant dans la console R ou plus simplement lire l'help de la fonction ?as.factor ou sur internet https://stat.ethz.ch/R-manual/R-deve...ml/factor.html.

simplement la fonction attend un vecteur et vous lui fournissez un objet qui n'est pas un vecteur donc elle transforme cette object en vecteur via as.character (d'ou les character) et transforme ensuite en facteur ce vecteur

[ptroy]

-pour lapply je pensais après avoir consulté l'aide que le "l" devant apply c'était pour "lenght" et non pour "list" que je comprends mieux du coup.
-concernant "chr" vous etes plus explicite que l'aide et je vous en remercie.

[ptroy]

En fait mon recodage n'a pas si bien fonctionné:
Quand j'importe mon fichier, R code par défaut ma variable "Tas" en variable factor.
Si je la recode en numeric car c'est une variable quantitative, il change toutes les valeurs de chaque observation....

[Alpacky]

serait-il possible d'avoir les 6 premières lignes du fameux fichier ? ce serait plus simple d'avoir un extrait des données pour pouvoir tester!
la conversion facteur => numeric n'est pas directe: voir l'help de la fonction et particulièrement la section warning https://stat.ethz.ch/R-manual/R-deve...ml/factor.html

enfin pourquoi voulez vous transformer en facteur des 0 et des 1? quelle utilité ?

[ptroy]

-dat est mon data.frame
-la variable dat$tas apparaît par défaut en "factor" (cf capture), or c'est en soit, une variable quantitative: je cherche donc à la recoder en variable de type "numeric" avec la syntaxe habituelle

Code :

Sélectionner tout - Visualiser dans une fenêtre à part

>dat$tas<-as.numeric(dat$tas)

ce qui conduit à ce que l'on observe dans la capture du message précédent, d'où ma surprise et le découragement qui va avec.

PS: je n'arrive pas à joindre le fichier Rdata ni csv en question: le gestionnaire de fichier me dit que ces formats ne sont pas autorisés

[Alpacky]

Premièrement, il n'y pas lieu d'être découragé, je viens de vous donner un lien qui explique que la technique classique as.numeric("un facteur") ne fonctionnera pas. Il faut donc procéder autrement, heureusement cela est indiqué dans le même lien.

Ensuite, il y a une option stringsAsFactors qui permet de ne pas convertir les strings en factors, cf l'help https://www.rdocumentation.org/packa...ics/read.table! Donc quand vous lirez vos données les colonnes facteurs apparaitront en character mais toujours pas en numéric car pour R tous les éléments ne sont pas tous des nombres. Pour le comprendre il suffit de regarder les niveaux de vos facteurs : par exemple tas ou anciennete. Parfois vous avez un facteur qui vaut "12,4" il faut donc revoir la façon dont vous importer les données. D'après votre appel de fonction vous avez un tsv donc la "," indique surement la partie décimale? Si c'est le cas en R c'est un "." et non une ",", qu'il faut utiliser. Il faut donc le préciser avec un argument que vous trouverez aussi dans l'help de la fonction et qui (surprise) s'appelle dec et a une valeur par défaut dec = ".".

Généralement, pour travailler sur les données c'est plus simple de ne pas avoir une photo car on ne peut pas copier coller les données..

[ptroy]

désolé j'ai pas encore les bons réflexes ...et merci je vais voir tout ça!

[Alpacky]

Ne le prenez pas mal, c'est une bonne chose de poser des questions mais ce que je voulais souligner c'est que certainement des gens se sont posés la même question que vous (donc un thread doit deja exister) ou de bien vous référer aux helps de fonction (même si ils sont parfois cryptiques) et enfin de mettre qqs données pour que l'on puisse facilement vous aider !
bon courage

[ptroy]

J'avoue avoir du mal avec help() mais j'ai finalement pu:
- effectivement limiter ce que R prenait pour des "factor" en arrondissant à l'entier quelques valeurs décimales (pas très casse mais la prochaine fois ce sera plus mieux)
- convertir les "factor" en numeric": il fallait d'abord recoder a variable "factor" en "character" avec as.character() puis recoder la variable obtenue en "numeric" avec as.numeric() (d'après le site anglophone R for "dummies" qui explique la notion de fonction emboitées qui crée ce "problème" de recodage.