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R Discussion :

Lecture d'un ficher, ##


Sujet :

R

  1. #1
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    Par défaut Lecture d'un ficher, ##
    Bonjour à tous,

    j'ai un jeu de données un peu particulier à analyser, et R ne le lis pas correctement.
    ce ficher est de la forme :

    gwas10.log.txt:## pve estimate in the null model = 0.28707
    gwas10.log.txt:## ve estimate in the null model = 820.614
    ...
    
    et après importation, le tableau dans R ne comporte que

    gwas10.log.txt:
    gwas10.log.txt:
    ...
    A chaque ligne, ce qui est derrière les '##' disparaît.

    Auriez vous une idée de l'explication, et sauriez-vous comment régler le problème ?

    Merci beaucoup !

  2. #2
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    Par défaut
    Bonjour,

    tout dépend de la fonction que tu as utilisée pour importer ton jeu de données. Dans le langage R le '#' sert a indiquer que tout ce qui suit est du commentaire. Par défaut quand tu utilises la fonction read.table, tout ce qui est derrière un #ne sera pas lu. Pour modifier ça il faut jouer sur l'argument comment.char, et par exemple faire read.table(..., comment.char = "£") de sorte que le symbole stipulant les commentaires lors de la lecture ne soit plus le # mais le £.

    cdlt

  3. #3
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    Par défaut
    Super ! Merci beaucoup pour l'astuce, je ne savais pas que c'était possible.

    Bonne journée

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