Discussion :

[anisle21]

Bonjour,

je débute en R, et je voudrais faire une ACP.

J'ai vu pca et dudi.pca, mais je n'arrive pas à comprendre la différence entre ces 2 ACP.

Merci de votre aide,

[faubry]

R est organisé en package et est sensible à la casse (majuscules/minuscules). Il est donc nécessaire de dire quel est le package (dudi.pca est dans le package ade4, sauf si quelqu'un d'autre à écrit une fonction avec le même nom dans un autre package) et faire attention aux majuscules et minuscules. Je n'ai aucune idée quant à pca, à moins que ce ne soit en réalité PCA du package FactoMineR ? Si c'est le cas, le choix entre les deux repose sur des choix personnels. FactoMineR est un package généraliste écrit par l'équipe autrefois dirigée par B. Escoffier (élève de J.P. Benzécri, le 'créateur' de ce qu'on appelle l'école française d'analyse des données) et actuellement par J. Pagès, considérée généralement comme l'équipe à l'origine des développements ultérieurs et donc équipe de référence. ade4 a été écrit par une équipe lyonnaise dans un contexte particulier d'utilisation. Fondamentalement, il n'y a aucune différence entre ces deux packages et ils sont, à ma connaissance, aussi fiables l'un que l'autre. FactoMineR peut être complété par les packages FactoInvestigate, SensoMineR et factoextra. ade4 possède en son sein des routines complétant aussi l'ACP. Personnellement j'utilise FactoMineR ayant travaillé avec des personnes issues de la filière Benzécri-Escoffier et que PCA gère directement les individus supplémentaires (ou illustratifs) et les variables supplémentaires, quelles soient quantitatives ou qualitatives..

[anisle21]

oui, effectivement, je n'ai pas encore pris l'habitude de la casse, mais aussi de donner les noms des packages associées aux fonctions.

je parlais bien de dudi.pca du package ade4, et de PCA du package FactoMineR.



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