Normalement root a déjà tous les privilèges, alors...
Je n'ai pas dit de changer les privilèges de root, seulement le mot de passe.
Phpmyadmin met un avertissement car il ne changera pas lui même sa configuration suite au changement de mot de passe ; la connexion en cours ne fonctionnera donc plus dés qu'on aura soumis le nouveau mot de passe.
Si on a fait une mauvaise manipulation, on peut toujours rétablir les droits en ligne de commande avec l'executable mysql.
GRANT ALL PRIVILEGES ON *.* TO 'root'@'localhost' WITH GRANT OPTION;
On peut même reinitialiser les mots de passe ; les sécurités ne s'appliquent qu'aux connexions.
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