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Bioinformatique Perl Discussion :

formatage de BD de Blast


Sujet :

Bioinformatique Perl

  1. #1
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    Par défaut formatage de BD de Blast
    Bonjour
    j'essaye en vain de formater une base de donnée de Blast a partir d'un jeu de séquence de nucléotides
    j'ai donc tapé la commande suivante "formatdb -i mon_jeu_de_seq.nt -p F -n mabasedb"
    pourtant quand je lance le blast il me dit que ma base est absente, j ai bien les 3 fichier générés par la commande mais quand je les ouvre avec un éditeur de texte j'ai tout sauf des nucléotides
    Est ce que quelqu'un aurait une idée ?
    merci

  2. #2
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    Par défaut
    j ai trouvé merci Blast n'aime pas les "|" dans l'ID d'une sequence

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