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Images Discussion :

Reconstruction 3D à partir des radiographes 2D


Sujet :

Images

  1. #1
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    Par défaut Reconstruction 3D à partir des radiographes 2D
    Bonjour,
    J’ai besoin de reconstruire une image 3D : représente la structure interne d’un objet de forme conique.
    Les données de projection 2D sont simulées après l’utilisation de la loi de transmission de Beer-Lambert.
    Quel sont les étapes essentielles, en utilisant le logiciel MatLab, pour faire cette étude.
    Merci de votre collaboration.

  2. #2
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    Par défaut Reconstruction 3D
    Malheureusement, je n'ai pas trouvé de solution à ce jour le 29 mai 2016.

    est ce qu'il y a une solution?

    comment réaliser un tableau en 3D?

  3. #3
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    Par défaut
    bonjour
    je pense que vous pouvez faire la reconstruction 3D si tu a un ensemble de coupes 2D !

  4. #4
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    Par défaut Reconstruction 3D à partir des radiographes 2D
    Grâce au logiciel MatLab, j’ai deux publications sur le traitement et la reconstruction des images 2D.

    A cette occasion, Je tiens à remercier tous les membres du Forum MatLab.

    Mais, la 3D nécessite l’empilement des images 2D. Cette étape est très difficile à réaliser.

    Je vous serais très reconnaissant si vous pouviez m'aider

  5. #5
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    Par défaut
    voila le code que j'ai utilisé pour faire de la reconstruction 3D avec plusieurs coupes
    Code : Sélectionner tout - Visualiser dans une fenêtre à part
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    25
    26
    27
    28
    clear all;
    close all;
    clc
    %lecture des images
    %initialisation
    I1=imread('C:\Users\INFOPLUS\Desktop\prgs mémoire M2\coupe\SE1.jpeg');
    [n m]=size(I1);
    I=zeros(n,m,9);
     
    for i=1:9
        chemin=cat(2,'C:\Users\INFOPLUS\Desktop\prgs mémoire M2\coupe\SE',num2str(i),'.jpeg');
        I(:,:,i)=imread(chemin);
    end
     
     
     
    close all;
    TSs=smooth3(I,'box',3);
     
     
    %subplot(1,2,2)
    p=patch(isosurface(TSs,0),'FaceColor', 'blue','EdgeColor','none');
    patch(isocaps(TSs,1),'FaceColor','interp','EdgeColor','yellow');
    isonormals(TSs,p);
    %isosurface(TSs,0);
    view(3);axis vis3d tight off
    camlight; lighting phong
    title('région cardiaque lissées');

  6. #6
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    Par défaut
    http://fr.mathworks.com/help/images/...transform.html

    reconstruire une image a partir de projection ====> transformé en radon

  7. #7
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    Par défaut Reconstruction 3D à partir des radiographes 2D
    Merci beaucoup,
    1. Les neuf images 2D reconstruite par MatLab sont enregistrées sous les noms SE1.jpg…..SE9.jpg dans le même répertoire.
    2. J’ai appliqué votre programme.
    3. La remarque donnée par MatLab est comme suite :
    ??? Subscriped assignment dimension dismatch.


    Quel est le Problème ?

  8. #8
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    Par défaut
    tes images ne font probablement pas la même taille.

    petit coquille de ma part la transformé en radon réalise les projection
    pour reconstruire a partir des projection il faut utilisé la transformé inverse
    http://fr.mathworks.com/help/images/ref/iradon.html

  9. #9
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    Par défaut
    oui c ça sont des coupes 2D successives et bien structurée de meme taille et aussi de meme format tu doit adaptés ces 2 derniers

  10. #10
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    Par défaut Reconstruction 3D à partir des radiographes 2D
    Salut gpcbitnik38 ,

    Vous avez raison.

    Mais cette étape de reconstruction 2D à partir des projections, en utilisant la transforme de radan, a été faite.

    d'autre part, nos images sont de même taille. Elles sont identiques (copier/coller)

  11. #11
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    Par défaut
    normalement la transformé inverse te calcule l'image directement.
    tu obtient quoi en sortie? peux-tu nous envoyer tes données?

  12. #12
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    Par défaut
    j'obtiens des images 2D.

  13. #13
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    Par défaut
    bonjour maryana 22

    Combien d’images avez-vous utilisée dans votre fichier ?

    Est-ce que 9 images ?

  14. #14
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    Par défaut
    j'ai utilisé 9 images et vous pouvez utilisé plus

  15. #15
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    Par défaut
    Bonjour maryana,

    Toujours le même message est affiché dans la Command Windows:

    ??? Subscripted assignment dimension mismatch.

    malgré que tous mes images ont le même dimension 342x342 pixels et le même format ".JPEG"

    pourquoi?

  16. #16
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    Par défaut
    bonjour
    moi aussi j'ai eu ce problème lorsque j'ai enregistré mes images en utilisant juste capture d'écran et lorsque j'ai enregistrer mes images avec la commande "imsave" donc sa marché trés bien

  17. #17
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    Par défaut
    Les fichier JPEG contiennent sans doute des images en couleurs RGB, donc sous forme de tableaux MxNx3

    Le tableau I n'a donc de tout évidence pas les bonnes tailles pour contenir différentes images de ce type…

    Pour simplifier, je préconise d'enregistrer les images dans un format en couleurs indexées sous forme de tableaux MXN

    A lire : Gestion des couleurs sous MATLAB
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    • conception mécanique 3D (Autodesk Fusion 360)
    • impression 3D (Ultimaker)
    • développement informatique (Python, MATLAB, C)
    • programmation de microcontrôleur (Microchip PIC, Arduino…)

    « J'étais le meilleur ami que le vieux Jim avait au monde. Il fallait choisir. J'ai réfléchi un moment, puis je me suis dit : "Tant pis ! J'irai en enfer" » (Saint Huck)

  18. #18
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    Par défaut
    Merci beaucoup,

    Toutes mes images sont en niveau de gris (noircissement), donc les couleurs sont pas nécessaire.

    Pour travailler que en Grayscale, quelles sont les modifications nécessaires ?

    Code : Sélectionner tout - Visualiser dans une fenêtre à part
    1
    2
    p=patch(isosurface(TSs,0),'FaceColor', 'blue','EdgeColor','none');
    patch(isocaps(TSs,1),'FaceColor','interp','EdgeColor','yellow');

  19. #19
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    Par défaut
    Bonjour maryana 22 et à tous;

    Merci beaucoup ; grâce à vous, j'ai réussi à faire l'empilement des images 2D.

    Je n’ai qu’un simple problème sur l'affichage de résultats!!

    L'image finale obtenue (3D) est composée qu'un seul niveau de gris. Ce qui ne reflète pas la structure interne de l’objet étudié. En plus, Le code n'affiche que le squelette externe de l'objet. L'intérieur de l'objet est complètement vide, pourquoi?

    je crois que il y a un problème durant la lecture des images 2D dans les premiers lignes du code affiché précédemment. Il considérait que les images 2D sont constituées seulement de deux couleurs (noir et blanc), pourquoi?

    SVP, d’aide moi pour solliciter ce problème

  20. #20
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    Par défaut
    dans ce cas vous pouvez faire une segmentation pour chaque structure dans les différentes coupes 2D et par la suite vous passerez à la reconstructions 3D des structures avec des couleurs différents et vous combinez entre tout les structures dans une seule image

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