Discussion :

[fourmizen]

je t'avoue que j'ai essayé de comprendre ton code en le manipulant, en commentant certaines lignes, en rajoutant des array, etc. pour essayer d'obtenir des niveaux mais j'ai juste réussi à comprendre la structure générale. Pour rajouter les niveaux là...je vois pas ! J'ai réussi à modifier uniquement la structure de [ID] mais pas le reste...

[fourmizen]

@Gene69 : je n'ai plus trop le temps là de m'en occuper mais je reprends ça à la rentrée ! Merci pour toute l'aide que tu m'as apportée jusqu'à présent déjà ! ++

[gene69]

bonjour

j'ai fait plusieurs corrections algorythmiques et proposé de nouveaux formats de sortie.
le code est ici:http://php.developpez.com/telecharge...rbre-de-newick

[fourmizen]

waou c'est du super beau boulot ! Je viens d'y jeter un coup d’œil c'est parfait

Maintenant il me reste plus qu'à créer une fonction récursive pour utiliser ta fonction formatRich !

Merci encore pour ton aide.

[fourmizen]

Je viens de passer un moment un peu plus long à tout regarder et juste pour te signaler que dans la fonction formatLayered, l'ID 6 (dans notre exemple celui qui est tout seul) n'apparait pas ! De plus l'idéal avec cette fonction serait d'avoir le même nombre d'apprenants à chaque niveau (qui représenterait le nombre de groupes que l'on peut faire). C'est à dire non pas d'avoir ça :

Code :

Sélectionner tout - Visualiser dans une fenêtre à part

1
2
3
4
5
6
7
8
9
10
11
12
13
14
15
16
17
18
19
20
21
22
23
24
25
26
27
28
29
30
31
32
33
34
35
36
37
38
39
40
41
42
43
44
45
46
47
48
49
50
51
52
53
54
55
56
57
58
59
60
61
62
63
64
65
66
67
68
69
70
71
72
73
74
75
76
77
78
79
80
81
82
83
84
85
86
87
88
89
90
91
92
93
94
95
96
97
98
99
100
101
102
103
104
105
106
107
108
109
110
111
112
113
114
115
116
117
118
119
120
121
122
123
124
125
126
127
128
129
130
131
132
133
134
135
136
137
138
139
140
141
142
143
144
145
146
Array
(
    [1] => Array
        (
            [0] => Array
                (
                    [Nom] => Anonymous
                    [Apprenants] => 9
                    [Distance] => Unknown
                    [ID] => Array
                        (
                            [0] => 1
                            [1] => 2
                            [2] => 5
                            [3] => 19
                            [4] => 3
                            [5] => 4
                            [6] => 7
                            [7] => 20
                            [8] => 6
                        )
 
                )
 
        )
 
    [2] => Array
        (
            [0] => Array
                (
                    [Nom] => Anonymous
                    [Apprenants] => 8
                    [Distance] => 0.14
                    [ID] => Array
                        (
                            [0] => 1
                            [1] => 2
                            [2] => 5
                            [3] => 19
                            [4] => 3
                            [5] => 4
                            [6] => 7
                            [7] => 20
                        )
 
                )
 
        )
 
    [3] => Array
        (
            [0] => Array
                (
                    [Nom] => Anonymous
                    [Apprenants] => 6
                    [Distance] => 0.59
                    [ID] => Array
                        (
                            [0] => 1
                            [1] => 2
                            [2] => 5
                            [3] => 19
                            [4] => 3
                            [5] => 4
                        )
 
                )
 
            [1] => Array
                (
                    [Nom] => Anonymous
                    [Apprenants] => 2
                    [Distance] => 0.57
                    [ID] => Array
                        (
                            [0] => 7
                            [1] => 20
                        )
 
                )
 
        )
 
    [4] => Array
        (
            [0] => Array
                (
                    [Nom] => Anonymous
                    [Apprenants] => 4
                    [Distance] => 0.05
                    [ID] => Array
                        (
                            [0] => 1
                            [1] => 2
                            [2] => 5
                            [3] => 19
                        )
 
                )
 
            [1] => Array
                (
                    [Nom] => Anonymous
                    [Apprenants] => 2
                    [Distance] => 0.08
                    [ID] => Array
                        (
                            [0] => 3
                            [1] => 4
                        )
 
                )
 
        )
 
    [5] => Array
        (
            [0] => Array
                (
                    [Nom] => Anonymous
                    [Apprenants] => 2
                    [Distance] => 0.05
                    [ID] => Array
                        (
                            [0] => 1
                            [1] => 2
                        )
 
                )
 
            [1] => Array
                (
                    [Nom] => Anonymous
                    [Apprenants] => 2
                    [Distance] => 0.04
                    [ID] => Array
                        (
                            [0] => 5
                            [1] => 19
                        )
 
                )
 
        )
 
)

mais ça :

Code :

Sélectionner tout - Visualiser dans une fenêtre à part

1
2
3
4
5
6
7
8
9
10
11
12
13
14
15
16
17
18
19
20
21
22
23
24
25
26
27
28
29
30
31
32
33
34
35
36
37
38
39
40
41
42
43
44
45
46
47
48
49
50
51
52
53
54
55
56
57
58
59
60
61
62
63
64
65
66
67
68
69
70
71
72
73
74
75
76
77
78
79
80
81
82
83
84
85
86
87
88
89
90
91
92
93
94
95
96
97
98
99
100
101
102
103
104
105
106
107
108
109
110
111
112
113
114
115
116
117
118
119
120
121
122
123
124
125
126
127
128
129
130
131
132
133
134
135
136
137
138
139
140
141
142
143
144
145
146
147
148
149
150
151
152
153
154
155
156
157
158
159
160
161
162
163
164
165
166
167
168
169
170
171
172
173
174
175
176
177
178
179
180
181
182
183
184
185
186
187
188
189
190
191
192
193
194
195
196
197
198
199
200
201
202
203
204
205
206
207
208
209
210
211
212
213
214
215
216
217
218
219
220
221
222
223
224
225
226
Array
(
    [1] => Array
        (
            [0] => Array
                (
                    [Nom] => Anonymous
                    [Apprenants] => 9
                    [Distance] => Unknown
                    [ID] => Array
                        (
                            [0] => 1
                            [1] => 2
                            [2] => 5
                            [3] => 19
                            [4] => 3
                            [5] => 4
                            [6] => 7
                            [7] => 20
                            [8] => 6
                        )
 
                )
 
        )
 
    [2] => Array
        (
            [0] => Array
                (
                    [Nom] => Anonymous
                    [Apprenants] => 8
                    [Distance] => 0.14
                    [ID] => Array
                        (
                            [0] => 1
                            [1] => 2
                            [2] => 5
                            [3] => 19
                            [4] => 3
                            [5] => 4
                            [6] => 7
                            [7] => 20
                        )
 
                )
            [1] => Array
                (
                    [Nom] => Anonymous
                    [Apprenants] => 1
                    [Distance] => 0.84
                    [ID] => Array
                        (
                            [0] => 6
                        )
 
                )
 
        )
 
    [3] => Array
        (
            [0] => Array
                (
                    [Nom] => Anonymous
                    [Apprenants] => 6
                    [Distance] => 0.59
                    [ID] => Array
                        (
                            [0] => 1
                            [1] => 2
                            [2] => 5
                            [3] => 19
                            [4] => 3
                            [5] => 4
                        )
 
                )
 
            [1] => Array
                (
                    [Nom] => Anonymous
                    [Apprenants] => 2
                    [Distance] => 0.57
                    [ID] => Array
                        (
                            [0] => 7
                            [1] => 20
                        )
 
                )
            [2] => Array
                (
                    [Nom] => Anonymous
                    [Apprenants] => 1
                    [Distance] => 0.84
                    [ID] => Array
                        (
                            [0] => 6
                        )
 
                )
 
        )
 
    [4] => Array
        (
            [0] => Array
                (
                    [Nom] => Anonymous
                    [Apprenants] => 4
                    [Distance] => 0.05
                    [ID] => Array
                        (
                            [0] => 1
                            [1] => 2
                            [2] => 5
                            [3] => 19
                        )
 
                )
 
            [1] => Array
                (
                    [Nom] => Anonymous
                    [Apprenants] => 2
                    [Distance] => 0.08
                    [ID] => Array
                        (
                            [0] => 3
                            [1] => 4
                        )
 
                )
            [2] => Array
                (
                    [Nom] => Anonymous
                    [Apprenants] => 2
                    [Distance] => 0.57
                    [ID] => Array
                        (
                            [0] => 7
                            [1] => 20
                        )
 
                )
            [3] => Array
                (
                    [Nom] => Anonymous
                    [Apprenants] => 1
                    [Distance] => 0.84
                    [ID] => Array
                        (
                            [0] => 6
                        )
 
                )
 
        )
 
    [5] => Array
        (
            [0] => Array
                (
                    [Nom] => Anonymous
                    [Apprenants] => 2
                    [Distance] => 0.05
                    [ID] => Array
                        (
                            [0] => 1
                            [1] => 2
                        )
 
                )
 
            [1] => Array
                (
                    [Nom] => Anonymous
                    [Apprenants] => 2
                    [Distance] => 0.04
                    [ID] => Array
                        (
                            [0] => 5
                            [1] => 19
                        )
 
                )
            [2] => Array
                (
                    [Nom] => Anonymous
                    [Apprenants] => 2
                    [Distance] => 0.08
                    [ID] => Array
                        (
                            [0] => 3
                            [1] => 4
                        )
 
                )
            [3] => Array
                (
                    [Nom] => Anonymous
                    [Apprenants] => 2
                    [Distance] => 0.57
                    [ID] => Array
                        (
                            [0] => 7
                            [1] => 20
                        )
 
                )
            [4] => Array
                (
                    [Nom] => Anonymous
                    [Apprenants] => 1
                    [Distance] => 0.84
                    [ID] => Array
                        (
                            [0] => 6
                        )
 
                )
 
        )
 
)

Tu penses que c'est possible à partir de ta fonction ?

[gene69]

de mémoire pour l'id 6 c'est parce qu'il doit être dans un groupe "anonyme" c'est à dire qu'il faudrait que tu nommes le noeud pour qu'il ressorte je crois ou sinon mettre la propriété $allNode à true oubien ya un bug.

je comprends toujours pas le parcours que tu veux faire de ton arbre de newick. tu veux réorganiser le layered non pas par la distance à la racine mais par rapport au nombre de feuilles et de branches à partir du niveau ?

ça devrait etre possible... il faut redéfinir un nouveau callback sur le model de doList() mais qui fera une tambouille différente. dans les parametres du callback "branch" on a un tableau $leafs qui est la liste des ID des noeuds dessous. par contre il ne faut plus utiliser register mais une version soit customisée soit en la dérivant dans une classe fille, soit en ajoutant une méthode à la classe (soit en la réécrivant mais bon ... ).