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de la même manière que tu récupères l'output, tu peux récupérer l'ErrorStream de ton process, ainsi que l'exitValue (cf doc)

en les loggant tu devrais avoir quelques indices de plus...

parmi le code que tu n'as pas montré, y a t'il un traitement de ton inputline ?

puisqu'il a l'air de manquer plusieurs éléments, voici un exemple de comment je traite les inputstreams de mes...