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Bonjour,

Je te conseille d'utiliser le module Config::Std.


use strict;
use Carp;
use warnings;
use Config::Std;

Bonjour,

Dans le cadre professionnel, je dois changer de logiciel de messagerie et passer de Thunderbird vers Outlook. J'ai pu importer mon carnet d'adresses mais savez-vous comment je pourrais...

Bonjour,

Mes propos seront sensiblement les mêmes que les deux précédents posts.

J'ai un diplôme en bioinfo, et j'exerce effectivement cette activité. Mais il faut savoir que les perspectives...

Bonjour,

Où est le lien du tutoriel ?

:merci:

La mise à jour de l'article est faite !! Elle détaille la dernière version du module !
Bonne lecture !

Bonjour,

Voici pêle-mêle des outils et logiciels pour l'analyse de données NGS. Avant d'utiliser Galaxy, je te conseillerai également de connaître la terminologie, les étapes clés et quelques...

Le programme des 3èmes Rencontres R (Montpellier - 26 et 27 juin 2014) est en ligne http://r2014-mtp.sciencesconf.org/program :


Jeudi 26 juin


Interactive graphic with ggvis (W. Chang,...

Bonjour,

Une nouvelle critique a été ajoutée pour le livre Data Visualisation. N'hésitez pas à le lire et à ajouter vos commentaires !

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Alors... Tu ne me sembles pas familier avec ces nouvelles technologies. Utiliser Blast n'est pas indiqué pour l'alignement des reads.. Tu risquerais d'attendre un temps certain, si ce n'est un...

Pour un même organisme, un même gène, tu trouveras très rarement une seule séquence qui cible ta région dans certaines bases de données. Sauf à interroger des bases sans redondance et avec les...

Je devine donc que vous avez aligné les séquences avec BLAST. L'une contre l'autre ? Sur une base de données ? Laquelle ?
Quels résultats avez-vous obtenus ?

Est-il possible d'avoir l'intitulé...

Bonjour ?

Quel est ton problème ? Tu ne comprends pas l'exercice ? Tu ne sais pas comment t'y prendre ? Tu as analysé tes séquences et tu ne sais pas quoi conclure ?

J'ai voté pour R et Autres également ! Pour les analyses statistiques et les bases de données.

Bonjour à tous,

Voici un nouveau sondage :



À vos plumes !

J'ai voté pour la version 5.14. C'est celle que j'utilise au boulot. Compatible avec toutes mes librairies, notamment BioPerl.

Bonjour,

Donc si je comprends bien, tu veux récupérer un nombre minimal de séquences dans ton jeu de données. Et pas .... Car dans ce cas, et comme le dit djibril, tu ne récupérerais aucune des...

Tu peux en effet venir ajouter des scripts dans la section Bioinformatique de la FAQ !
Au plaisir de te lire bientôt alors :-) !

Bonjour,

J'ai participé aussi
"Votre score : 10 / 10 Bravo pour cette performance" !

J'attends la suite !

C'est parfait !

Un petit tag résolu peut-être ?!

Bonjour,

Il est probable que cela provienne de la façon dont tu parses ton fichier. En effet, le module Bio :: Seq met l'ensemble des séquences en mémoire. Vu la taille de ton fichier, il est bien...

Merci pour ces informations :ccool:!

Merci pour cette information.

Cela m'oblige toutefois à relancer le script original et à régénérer les fichiers de plus de 16Go. L'après-midi va être longue ..

Bonjour à tous,

J'ai utilisé le module
use Data::Dumper; pour parser des fichiers de plus de 16Go. J'ai afficher la sortie dans un fichier texte :



open my $fh,'<',$file || die "Unable to...

Bonjour,

Afin de donner envie aux forumeurs de t'aider, il faudrait expliciter davantage ton problème. Tu as juste posé l'énoncé de ton exercice et tu sembles attendre la solution clé en main....

Bonjour,

Il faut garder en mémoire le numéro de ligne qui respecte ta condition particulière et ainsi, tu pourras afficher les neuf lignes suivantes.

Exemple :


my $fin;
while(<FILEH>) {
...