Windows ne tient pas compte de la casse en principe, majuscule et minuscule c'est pareil pour lui.
Le pourquoi il te met des majuscules dans ton fichier alors que tu n'en a pas demandé, ca je pense que c'est plus lié a ta fonction java que tu utilises, non? je ne vois pas pourquoi windows te transformerait ton nom de fichier. As tu essayé sur un PC différent pour tester le comportement?
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