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Bioinformatique Perl

Forum Bioinformatique Perl

Toutes vos questions sur les scripts Perl associés à la bioinformatique, modules bioperl, projets bioinformatiques, etc ... Avant de poster, veuillez consulter les cours Perl et les critiques de livres.

  1. comment retirer de manière spécifique des régions ne se liant pas à un alignement?

    Créée par vinserm, 23/09/2016 15h50
    • Réponses: 4
    • Affichages: 1 173
    vinserm
    03/10/2016, 13h49 Aller au dernier message

  2. association de données de 2 fichiers

    Créée par hermet, 08/09/2016 09h32
    • Réponses: 4
    • Affichages: 1 208
    Lolo78
    09/09/2016, 00h37 Aller au dernier message

  3. Séquence complémentaire

    Créée par BOUSSEBER, 20/01/2013 19h28
    • Réponses: 3
    • Affichages: 1 627
    Gardyen
    21/01/2013, 15h57 Aller au dernier message

  4. problème parser fichier

    Créée par pontarose, 02/08/2010 18h10
    • Réponses: 3
    • Affichages: 1 416
    pontarose
    04/08/2010, 09h54 Aller au dernier message

  5. blast sur base de données relationnelle

    Créée par horzy, 19/08/2010 13h20
    • Réponses: 3
    • Affichages: 1 760
    djibril
    20/08/2010, 15h28 Aller au dernier message

  6. Parser pour Jackhmmer ?

    Créée par loula427, 22/08/2010 03h54
    • Réponses: 3
    • Affichages: 1 572
    mathgon
    08/09/2010, 13h56 Aller au dernier message

  7. Localisation gènes sur GenBank

    Créée par dodup64, 03/02/2011 12h17
    • Réponses: 3
    • Affichages: 2 068
    Beniou
    04/02/2011, 17h33 Aller au dernier message

  8. Undefined subroutine &Bio::SearchIO called

    Créée par alaninho, 23/11/2011 11h13
    • Réponses: 3
    • Affichages: 1 707
    Beniou
    23/11/2011, 15h35 Aller au dernier message

  9. problème pour lancer un blast avec bioperl

    Créée par alaninho, 23/11/2011 11h16
    • Réponses: 3
    • Affichages: 1 732
    mathgon
    24/11/2011, 14h59 Aller au dernier message

  10. Lecture de fichier en BioPerl

    Créée par Quantactique, 25/04/2012 16h20
    • Réponses: 3
    • Affichages: 1 631
    Quantactique
    02/05/2012, 17h02 Aller au dernier message

  11. Extraire une sous-séquence d'un fasta

    Créée par pontarose, 13/06/2012 14h36
    • Réponses: 3
    • Affichages: 2 043
    Quantactique
    20/06/2012, 02h43 Aller au dernier message

  12. un problème académique

    Créée par anoir19, 27/08/2012 00h08
    • Réponses: 3
    • Affichages: 1 704
    stoyak
    28/08/2012, 10h03 Aller au dernier message

  13. Bio EnsEMBL DBSQL DBAdaptor

    Créée par Jane Home, 09/02/2010 11h49
    • Réponses: 3
    • Affichages: 1 998
    Beniou
    10/02/2010, 23h57 Aller au dernier message

  14. Blast via Bioperl => erreur

    Créée par Kawaccino, 12/03/2013 14h59
    • Réponses: 3
    • Affichages: 1 852
    Kawaccino
    13/03/2013, 10h51 Aller au dernier message

  15. comparaison de fichiers SAM

    Créée par karaudrey88, 27/03/2013 09h51
    • Réponses: 3
    • Affichages: 1 744
    trex7g2
    29/03/2013, 11h49 Aller au dernier message

  16. perl Bio::SeqIO /probleme primary_id et desc

    Créée par pontarose, 28/03/2014 11h24
    • Réponses: 3
    • Affichages: 1 452
    Gardyen
    28/03/2014, 16h14 Aller au dernier message

  17. Extraction des genes d'un fichier à partir d'une liste

    Créée par hin175, 10/08/2014 18h28
    • Réponses: 3
    • Affichages: 1 392
    Lolo78
    11/08/2014, 19h44 Aller au dernier message

  18. association de 2 fichiers

    Créée par hermet, 22/02/2017 10h09
    • Réponses: 3
    • Affichages: 727
    Gardyen
    23/02/2017, 14h54 Aller au dernier message

  19. Busco.ezlab v3 ne fonctionne plus

    Créée par Grendel26, 10/02/2018 08h23
    • Réponses: 3
    • Affichages: 1 542
    Lolo78
    11/02/2018, 22h43 Aller au dernier message

  20. Interface graphique blast

    Créée par Guidon26, 19/03/2019 11h53
    • Réponses: 3
    • Affichages: 1 026
    Gardyen
    20/03/2019, 08h57 Aller au dernier message

  21. pb avec clustalW

    Créée par Bioinfoe, 19/01/2010 19h59
    • Réponses: 3
    • Affichages: 1 741
    angioedema
    22/01/2010, 10h50 Aller au dernier message

  22. CLUSTALDIR invite de commande

    Créée par Jasmine80, 06/03/2007 12h32
    • Réponses: 3
    • Affichages: 1 769
    Jasmine80
    08/03/2007, 11h55 Aller au dernier message

  23. Bioperl et clustalw

    Créée par fren7fr, 10/05/2007 14h56
    1 pièce(s) jointe(s)
    • Réponses: 3
    • Affichages: 2 081
    fren7fr
    11/05/2007, 09h47 Aller au dernier message

  24. Problème de réinitialisation

    Créée par Jasmine80, 08/08/2007 10h09
    • Réponses: 3
    • Affichages: 1 594
    Jasmine80
    08/08/2007, 14h56 Aller au dernier message

  25. Conseil sur la bioinformatique

    Créée par carriebradshaw, 26/03/2008 20h17
    • Réponses: 3
    • Affichages: 1 483
    Jasmine80
    20/05/2008, 13h29 Aller au dernier message

  26. Récuperation de plusieurs fiches Genbank

    Créée par myosotis29, 14/08/2008 19h57
    • Réponses: 3
    • Affichages: 1 285
    Jasmine80
    21/08/2008, 13h38 Aller au dernier message

  27. Aide pour l'utilisation de Glam2 et Glam2mask

    Créée par Petitchaoui, 01/02/2009 18h24
    • Réponses: 3
    • Affichages: 885
    MaliciaR
    05/02/2009, 23h43 Aller au dernier message

  28. BLast en local

    Créée par selson, 17/03/2009 11h25
    • Réponses: 3
    • Affichages: 985
    MaliciaR
    22/03/2009, 12h16 Aller au dernier message

  29. temps de calcul

    Créée par chêne, 26/03/2009 16h04
    • Réponses: 3
    • Affichages: 1 320
    thierry.chich
    31/03/2009, 23h08 Aller au dernier message

  30. BioMart Récupération de données

    Créée par Saoua83, 02/06/2009 10h41
    • Réponses: 3
    • Affichages: 3 323
    fripette
    18/08/2009, 08h59 Aller au dernier message

  31. OO méthode multiple_digest de Bio::Restriction::Analysis

    Créée par Jasmine80, 02/09/2009 11h35
    • Réponses: 3
    • Affichages: 1 311
    Jasmine80
    02/09/2009, 15h24 Aller au dernier message

  32. faire du clustering hierarchique avec Bioperl

    Créée par zaboug, 07/09/2009 17h19
    2 pièce(s) jointe(s)
    • Réponses: 3
    • Affichages: 2 327
    zaboug
    08/09/2009, 09h55 Aller au dernier message

  33. OO récupération d'informations sur GenBank

    Créée par Jasmine80, 28/09/2009 13h03
    • Réponses: 3
    • Affichages: 1 930
    angioedema
    03/06/2010, 11h20 Aller au dernier message

  34. recherche de tuto

    Créée par max1395, 23/12/2009 17h44
    • Réponses: 3
    • Affichages: 1 662
    angioedema
    01/03/2010, 11h09 Aller au dernier message

  35. Convertir séquence ADN => entier unique ?

    Créée par ctobini, 24/09/2007 11h48
    • Réponses: 2
    • Affichages: 2 545
    ctobini
    04/10/2007, 10h20 Aller au dernier message

  36. traitement sortie blast

    Créée par pierrot2908, 02/05/2007 16h44
    • Réponses: 2
    • Affichages: 1 712
    pierrot2908
    02/05/2007, 23h16 Aller au dernier message

  37. récupération domaine protéique bioperl

    Créée par puce63, 14/03/2007 19h44
    • Réponses: 2
    • Affichages: 1 552
    puce63
    15/03/2007, 13h05 Aller au dernier message

  38. [BioPerl] Run::Alignment::Clustalw erreur

    Créée par crochepatte, 24/01/2007 10h26
    • Réponses: 2
    • Affichages: 1 844
    djibril
    24/01/2007, 12h09 Aller au dernier message

  39. recherche d'informations dans des objets de genbank

    Créée par Jasmine80, 16/02/2007 12h27
    • Réponses: 2
    • Affichages: 1 497
    Jasmine80
    05/03/2007, 16h20 Aller au dernier message

  40. Problème d'affichage de tableaux

    Créée par Jasmine80, 30/01/2007 16h20
    • Réponses: 2
    • Affichages: 1 454
    Jasmine80
    02/02/2007, 11h37 Aller au dernier message
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