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Bioinformatique Perl Discussion :

Gbrowse - pb d'affichage si plus d'un référentiel


Sujet :

Bioinformatique Perl

  1. #1
    Membre averti Avatar de sohnic
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    Par défaut Gbrowse - pb d'affichage si plus d'un référentiel
    Bonjour,
    J'ai installé Gbrowse, mon but étant d'afficher des résultats de blast.
    J'ai donc plusieurs Queries, qui après blastn s'alignent avec, pour chacune d'entre elles avec plusieurs hits (subject), sous forme d'HSP multiples pour ces hits.

    J'ai résolu mon premier problème, à savoir obtenir pour chaque query une visualisation claire de l'ensemble des hits, chaque HSP pour un hit donné étant sur une ligne et relié entre eux par une fine ligne.

    Mais, si je demande à visualiser l'ensemble de mes queries (pour l'instant il n'y en a que 2), alors je ne visualise plus les hits pour chacune d'elle.

    J'ai joint 2 copies d'écran pour plus de clarté.

    Si quelqu'un est suceptible de m'aider, je peux bien sur fournir les fichiers gff3 et .conf.

    Merci pour votre aide,

    Sohnic
    Images attachées Images attachées   
    http://www.noctinfo.fr/

    (\ _ /)
    (='.'=) Voici Lapinou. Aidez-le à conquérir le monde en le reproduisant.
    (")-(")

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