Discussion :

[Osecours]

Bonjour à tous !
je suis nouvelle sur ce forum, et je vous dis honnetement que je ne suis pas une bioinformaticienne, et justement je suis ici pour solliciter aux ames charitables un groo coup de main .
Voilà j'ai d'énormes données de Chip-Chip sous format .gff (ou .txt... avec 800 000 lignes environ) et je voudrais qu'on m'explique comment les analyser...
Je m'explique je voudrais faire une sorte de heatmap à partir du score(enrichissement-appauvrissement), extraire les régions qui se comportent pareils...etc...J'ai essayé de chercher un tas de software sur le net, mais impossible de tomber sur un clair, gratuit et facile d'utilisation...
Est-ce que quelqu'un pourrait bien m'aider ou me guider please (ou me donner des cours!!) je suis complètement paumée...?

[stoyak]

Bonjour,

En première lecture rapide, tu veux grouper tes régions en fonction du score d'enrichissement .... Commence par lire ce post, et vois si cela correspondrait à ton besoin.

Après lecture, reviens nous voir.