Discussion :

[zaboug]

Bonjour à tous,

j'aimerais générer une image (cf. pièce jointe) via perl.

à partir de mes données, je suis capable de générer un fichier de ce type :

Code :

Sélectionner tout - Visualiser dans une fenêtre à part

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              +----+----+----+----+----+
              | S1 | S2 | S3 | S4 | S5 |
 +------------+----+----+----+----+----+
 |TEAD2       |   1|   1|   1|   1|   1|
 +------------+----+----+----+----+----+
*|PSMD7       |   1|   0|   0|   1|   0|
 +------------+----+----+----+----+----+
*|PRKAB2      |   0|   1|   0|   0|   1|
 +------------+----+----+----+----+----+
*|SV2C        |   0|   1|   0|   1|   1|
 +------------+----+----+----+----+----+
*|EIF5A       |   1|   0|   0|   1|   1|
 +------------+----+----+----+----+----+

Maintenant, je cherche un moyen pour générer l'image : les cases contenant un 1 doivent être rouge, et les cases contenant un 0 doivent être verte.

Le problème, c'est que je n'ai jamais générer d'image en Perl.
J'aimerais avoir quelques conseils sur la manière de s'y prendre :
vaut-il mieux que je me mettes à apprendre le Perl/Tk, le CGI?
Existe-il d'autres solutions pour générer des images?
Vaut-il mieux générer les données avec des 0 et des 1 en Perl puis passer à une autre techno pour générer l'image?

Je ne sais pas dans quelles direction chercher, donc la moindre piste me serait utile

Petit détail important : je dois générer cette image pour le boulot, et mon contrat se termine dans 3 semaines. Je ne peux donc pas me permettre d'utiliser une méthode trop longue à apprendre...

[djibril]

Utilise le module GD pour générer des images à la volée en Perl.

[zaboug]

merci beaucoup pour cette réponse si rapide.

je vais étudié ce module de plus près

je mettrai ici le code de mon script (quand il sera écrit ), ça pourra toujours servir

[zaboug]

chose promise, chose due : voila la partie de mon script permettant de générer l'image :

Code :

Sélectionner tout - Visualiser dans une fenêtre à part

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#!/usr/bin/perl -w
 
use strict;
use GD;
 
[...]
 
## Generation d'une image
# create a new image
my $img = new GD::Image(550,2400);
 
# allocate some colors
my $white = $img->colorAllocate(255,255,255);
my $black = $img->colorAllocate(0,0,0);       
my $red   = $img->colorAllocate(255,0,0);      
my $green = $img->colorAllocate(0,255,0);
 
 
# Ecriture de la legende en haut de l'image :
$img -> string(gdMediumBoldFont, 2,10, "Liste des situations : ",$black);
$img -> string(gdSmallFont, 10,20, "S1 : SAGE_Embryonic_stem_cell_H1_normal_p31_CL_SHE17",$black);
$img -> string(gdSmallFont, 10,30, "S2 : SAGE_Embryonic_stem_cell_H1_normal_p54_CL_SHE16",$black);
$img -> string(gdSmallFont, 10,40, "S3 : SAGE_Embryonic_stem_cell_H9_normal_p38_CL_SHES2",$black);
$img -> string(gdSmallFont, 10,50, "S4 : SAGE_Embryonic_stem_cell_HES3_normal_p16_CL_SHE10",$black);
$img -> string(gdSmallFont, 10,60, "S5 : SAGE_Embryonic_stem_cell_HES4_normal_p36_CL_SHE11",$black);
$img -> string(gdSmallFont, 10,75, "Les lignes commencant par une etoile correspondent aux genes cibles de TEAD2",$black);
 
# Ecriture de la ligne de titre du tableau gene_cibles
$img -> string(gdGiantFont, 5, 100, "Genes cibles de TEAD2", $black);
$img -> string(gdMediumBoldFont, 100, 130, " S1", $black);
$img -> string(gdMediumBoldFont, 120, 130, " S2", $black);
$img -> string(gdMediumBoldFont, 140, 130, " S3", $black);
$img -> string(gdMediumBoldFont, 160, 130, " S4", $black);
$img -> string(gdMediumBoldFont, 180, 130, " S5", $black);
 
 
# Ecriture de la ligne de titre du tableau gene_non_cibles
$img -> string(gdGiantFont, 250, 100, "Autres genes des concepts", $black);
 
$img -> string(gdMediumBoldFont, 350, 130, " S1", $black);
$img -> string(gdMediumBoldFont, 370, 130, " S2", $black);
$img -> string(gdMediumBoldFont, 390, 130, " S3", $black);
$img -> string(gdMediumBoldFont, 410, 130, " S4", $black);
$img -> string(gdMediumBoldFont, 430, 130, " S5", $black);
 
my ($y1,$y2) = (145,165);
my ($x1, $x2);
 
 
foreach my $tag (keys(%infos_cible))
{
	my $S1 = $infos_cible{$tag}->{'SAGE_Embryonic_stem_cell_H1_normal_p31_CL_SHE17'};
	my $S2 = $infos_cible{$tag}->{'SAGE_Embryonic_stem_cell_H1_normal_p54_CL_SHE16'};
	my $S3 = $infos_cible{$tag}->{'SAGE_Embryonic_stem_cell_H9_normal_p38_CL_SHES2'};
	my $S4 = $infos_cible{$tag}->{'SAGE_Embryonic_stem_cell_HES3_normal_p16_CL_SHE10'};
	my $S5 = $infos_cible{$tag}->{'SAGE_Embryonic_stem_cell_HES4_normal_p36_CL_SHE11'};
 
	($x1, $x2) = (100, 120);
 
	&draw_line($tag, $S1, $S2, $S3, $S4, $S5, 'left');
 
	($y1,$y2) = ($y1+20, $y2+20);
}
 
 
 
($y1,$y2) = (145,165);
 
 
foreach my $tag (keys(%infos_non_cible))
{
	my $S1 = $infos_non_cible{$tag}->{'SAGE_Embryonic_stem_cell_H1_normal_p31_CL_SHE17'};
	my $S2 = $infos_non_cible{$tag}->{'SAGE_Embryonic_stem_cell_H1_normal_p54_CL_SHE16'};
	my $S3 = $infos_non_cible{$tag}->{'SAGE_Embryonic_stem_cell_H9_normal_p38_CL_SHES2'};
	my $S4 = $infos_non_cible{$tag}->{'SAGE_Embryonic_stem_cell_HES3_normal_p16_CL_SHE10'};
	my $S5 = $infos_non_cible{$tag}->{'SAGE_Embryonic_stem_cell_HES4_normal_p36_CL_SHE11'};
 
	($x1, $x2) = (350, 370);
 
	&draw_line($tag, $S1, $S2, $S3, $S4, $S5, 'right');
 
	($y1,$y2) = ($y1+20, $y2+20);
 
}
 
 
# make sure we are writing to a binary stream
binmode STDOUT;
 
# Convert the image to PNG and print it on standard output
print $img->png;
 
 
 
 
 
 
sub draw_line
{
	my ($tag, $S1, $S2, $S3, $S4, $S5, $col) = @_;
 
	if($col eq 'left')
	{
		$img -> string(gdSmallFont, 5, $y1, "* $tag", $black);
	}
	else
	{
		$img -> string(gdSmallFont, 250, $y1, "  $tag", $black);
	}
 
	if($S1 == 1)
	{
		$img -> filledRectangle($x1,$y1,$x2,$y2,$red);
	}
	else
	{
		$img -> filledRectangle($x1,$y1,$x2,$y2,$green);
	}
 
	($x1, $x2) = ($x1 + 20, $x2 + 20);
	if($S2 == 1)
	{
		$img -> filledRectangle($x1,$y1,$x2,$y2,$red);
	}
	else
	{
		$img -> filledRectangle($x1,$y1,$x2,$y2, $green);
	}
 
	($x1, $x2) = ($x1 + 20, $x2 + 20);
	if($S3 == 1)
	{
		$img -> filledRectangle($x1,$y1,$x2,$y2,$red);
	}
	else
	{
		$img -> filledRectangle($x1,$y1,$x2,$y2,$green);
	}
 
	($x1, $x2) = ($x1 + 20, $x2 + 20);
	if($S4 == 1)
	{
		$img -> filledRectangle($x1,$y1,$x2,$y2,$red);
	}
	else
	{
		$img -> filledRectangle($x1,$y1,$x2,$y2,$green);
	}
 
	($x1, $x2) = ($x1 + 20, $x2 + 20);
	if($S5 == 1)
	{
		$img -> filledRectangle($x1,$y1,$x2,$y2,$red);
	}
	else
	{
		$img -> filledRectangle($x1,$y1,$x2,$y2,$green);
	}
}

[djibril]