chemin d'un module présent dans @INC mais pas trouvé par un script

**zaboug** · 12/06/2009, 15h09

Bonjour,

J'ai un souci un peu bizarre. Je dois reprendre le développement d'un site Web utilisant des CGI etbeaucoup d'autres modules Perl. Pour pouvoir le faire, j'ai commencé par copier le site en local (car il est déjà en production) et par installer sur ma machine tous les modules perl dont il a besoin.

Mais quand je teste une des pages du site, j'obtiens l'erreur suivante :

Code :

Sélectionner tout - Visualiser dans une fenêtre à part

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Can't locate GD.pm in @INC (@INC contains: 
/Library/Perl/Updates/5.8.8/darwin-thread-multi-2level 
/Library/Perl/Updates/5.8.8 
/System/Library/Perl/5.8.8/darwin-thread-multi-2level 
/System/Library/Perl/5.8.8 
/Library/Perl/5.8.8/darwin-thread-multi-2level 
/Library/Perl/5.8.8 /Library/Perl 
/Network/Library/Perl/5.8.8/darwin-thread-multi-2level 
/Network/Library/Perl/5.8.8 
/Network/Library/Perl
/System/Library/Perl/Extras/5.8.8/darwin-thread-multi-2level 
/System/Library/Perl/Extras/5.8.8
/Library/Perl/5.8.6 
/Library/Perl/5.8.1 .) 
at /Library/WebServer/CGI-Executables/tree_visualizer.cgi line 11.
BEGIN failed--compilation aborted at /Library/WebServer/CGI-Executables/tree_visualizer.cgi line 11.

Ce qui est bizarre, c'est que je viens d'installer le module GP.pm en question. Il se trouve dans le dossier suivant :

/sw/lib/perl5/5.8.8/darwin-thread-multi-2level/

il apparait clairement que ce chemin n'est pas dans la variable @INC ci-dessus.
Sauf que la commande perl -V me donne :

Code :

Sélectionner tout - Visualiser dans une fenêtre à part

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mathilde@cgmc134:~$ perl -V
[...]
%ENV:
    PERL5LIB="/sw/lib/perl5:/sw/lib/perl5/darwin"
  @INC:
    /sw/lib/perl5/5.8.8/darwin-thread-multi-2level
    /sw/lib/perl5/5.8.8
    /sw/lib/perl5/darwin-thread-multi-2level
    /sw/lib/perl5
    /sw/lib/perl5/darwin
    /Library/Perl/Updates/5.8.8/darwin-thread-multi-2level
    /Library/Perl/Updates/5.8.8
    /System/Library/Perl/5.8.8/darwin-thread-multi-2level
    /System/Library/Perl/5.8.8
    /Library/Perl/5.8.8/darwin-thread-multi-2level
    /Library/Perl/5.8.8
    /Library/Perl
    /Network/Library/Perl/5.8.8/darwin-thread-multi-2level
    /Network/Library/Perl/5.8.8
    /Network/Library/Perl
    /System/Library/Perl/Extras/5.8.8/darwin-thread-multi-2level
    /System/Library/Perl/Extras/5.8.8
    /Library/Perl/5.8.6
    /Library/Perl/5.8.1
    .

Je comprends pas pourquoi le site ne cherche pas dans tous les dossiers présents dans la variable @INC...

**zaboug** · 15/06/2009, 11h40

ce sous-forum n'a pas l'air beaucoup fréquenté

Personne n'a d'idée pour m'aider??

**Philou67430** · 15/06/2009, 12h24

Si, mais pas de réponse...
Essaye de trouver ton module avec Module::Find

**djibril** · 15/06/2009, 12h49

Hum, comment as tu installé ce module ?
Vu tes messages, tu es sous MAC et tu as sûrement installé ton module avec fink ?
J'ai l'impression que ton module a uniquement été installé dans le répertoire sw et à disposition de tout le monde. Je me souviens plus sou s Mac, mais es tu sous root?

Essaye d'installer ton module comme décrit dans mon article ou la FAQ, et dis nous si c'est OK.

De plus, montre nous le début de ton script avec tous les use, etc.

**zaboug** · 15/06/2009, 13h27

en effet, j'ai installer le module avec Fink, et il se trouve dans le répertoire /sw.

Ce qui est bizarre, c'est que ce répertoire est bien dans le @INC de Perl quand on fait perl -V, mais qu'il n'y est plus quand le script CGI s'exécute.

Voici le début du script :

Code :

Sélectionner tout - Visualiser dans une fenêtre à part

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#!/usr/bin/perl
 
 
use lib '/sw/lib/perl5';
use lib '/sw/lib/perl5/darwin';
use warnings;
use strict;
use CGI::Carp qw(fatalsToBrowser);
use CGI::Fast;
use CGI qw/:standard :html3/;
use FCGI;
use DBI;
use GD;
use CSS;
 
use Bio::Tree::Draw::Cladogram;
use Bio::Matrix::IO::phylip;
use Bio::Matrix::MatrixI;
use Bio::Matrix::PhylipDist;
use Bio::Matrix::Scoring;
use Bio::Tree::TreeFunctionsI;
use Bio::Tree::TreeI;
use Bio::Tree::NodeI;
use Bio::TreeIO;
use Bio::Tree::DistanceFactory;
use Bio::Tree::RandomFactory;
use Test::Data qw(Array);
use PostScript::File;
use PostScript::Simple;
use PostScript::Simple::EPS;

j'ai ajouté les deux premières lignes pour voir, et ça marche comme ça. Cela dit, je ne comprends pas pourquoi le script CGI ne prends pas en compte tous les dossiers qu'il y a dans le @INC.
pour rappel, voici ce que me donne perl -V :

Code :

Sélectionner tout - Visualiser dans une fenêtre à part

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Built under darwin
  Compiled at Mar 11 2009 16:09:08
  %ENV:
    PERL5LIB="/sw/lib/perl5:/sw/lib/perl5/darwin"
  @INC:
    /sw/lib/perl5/5.8.8/darwin-thread-multi-2level
    /sw/lib/perl5/5.8.8
    /sw/lib/perl5/darwin-thread-multi-2level
    /sw/lib/perl5
    /sw/lib/perl5/darwin
    /Library/Perl/Updates/5.8.8/darwin-thread-multi-2level
    /Library/Perl/Updates/5.8.8
    /System/Library/Perl/5.8.8/darwin-thread-multi-2level
    /System/Library/Perl/5.8.8
    /Library/Perl/5.8.8/darwin-thread-multi-2level
    /Library/Perl/5.8.8
    /Library/Perl
    /Network/Library/Perl/5.8.8/darwin-thread-multi-2level
    /Network/Library/Perl/5.8.8
    /Network/Library/Perl
    /System/Library/Perl/Extras/5.8.8/darwin-thread-multi-2level
    /System/Library/Perl/Extras/5.8.8
    /Library/Perl/5.8.6
    /Library/Perl/5.8.1
    .

J'ai l'impression que les dossiers de Fink sont ajouté à @INC grâce à la ligne %ENV. Peut être que le script ne prend pas en compte cette ligne?

Djibril, tu crois que c'est vraiment nécessaire de réinstaller le module en utilisant cpan? Les deux lignes ajoutées en début de script ne peuvent pas suffir?

**djibril** · 15/06/2009, 13h42

Tu les as installé avec les droits root ? Sinon par curiosité, j'aurais tout de même installé le module via le CPAN pour être sûr. Car ta solution, bien qu'elle fonctionne ne parait pas la plus propre.

**zaboug** · 15/06/2009, 13h47

je ne crois pas les avoir installer avec les droits root, mais fink demande le mot de passe pour toute installation...

Je vais réinstaller le module via cpan, il devrait plus y avoir de pb. Je te tiens au courant dès que c'est fait

**zaboug** · 15/06/2009, 14h11

Bon, maintenant, il trouve bien les modules (j'ai tout réinstallé via cpan).

Par contre, j'ai une nouvelle erreur :

Code :

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Can't load '/Library/Perl/5.8.8/darwin-thread-multi-2level/auto/GD/GD.bundle' for module GD: dlopen(/Library/Perl/5.8.8/darwin-thread-multi-2level/auto/GD/GD.bundle, 1): Library not loaded: /sw/lib/libjpeg.62.dylib
  Referenced from: /Library/Perl/5.8.8/darwin-thread-multi-2level/auto/GD/GD.bundle
  Reason: image not found at /System/Library/Perl/5.8.8/darwin-thread-multi-2level/DynaLoader.pm line 230.
 at /Library/WebServer/CGI-Executables/tree_visualizer.cgi line 13
Compilation failed in require at /Library/WebServer/CGI-Executables/tree_visualizer.cgi line 13.
BEGIN failed--compilation aborted at /Library/WebServer/CGI-Executables/tree_visualizer.cgi line 13.

je vois qu'il cherche encore des trucs dans le dossier /sw (celui de fink), pourtant j'ai supprimé ce dossier, justement pour pas qu'il n'y ait de compétition entre les deux...

mais perl n'a pas pris en compte cette suppression :

Code :

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mathilde@cgmc134:~$ perl -v
[...]
  Compiled at Mar 11 2009 16:09:08
  %ENV:
    PERL5LIB="/sw/lib/perl5:/sw/lib/perl5/darwin"
  @INC:
    /sw/lib/perl5
    /sw/lib/perl5/darwin
    /Library/Perl/Updates/5.8.8/darwin-thread-multi-2level
    /Library/Perl/Updates/5.8.8
    /System/Library/Perl/5.8.8/darwin-thread-multi-2level
    /System/Library/Perl/5.8.8
    /Library/Perl/5.8.8/darwin-thread-multi-2level
    /Library/Perl/5.8.8
    /Library/Perl
    /Network/Library/Perl/5.8.8/darwin-thread-multi-2level
    /Network/Library/Perl/5.8.8
    /Network/Library/Perl
    /System/Library/Perl/Extras/5.8.8/darwin-thread-multi-2level
    /System/Library/Perl/Extras/5.8.8
    /Library/Perl/5.8.6
    /Library/Perl/5.8.1
    .

je ne comprends pas bien...

**djibril** · 15/06/2009, 14h30

Il fallait désinstaller les modules que tu as installé avec fink en utilisant fink.
Puis tu peux utiliser.
Utilise ce code pour désinstaller un des modules.

**zaboug** · 15/06/2009, 14h40

bah, j'ai testé le script que tu m'as donné, mais il marche pas car il ne trouve pas les modules. Mais en même temps, tout ce qui est installé par fink, est installé dans le dossier /sw. Donc en supprimant ce dossier, on supprime tous les modules installés par fink... non?

**djibril** · 15/06/2009, 14h44

Oui mais bon, je ne sais pas s'il crée des dépendance ailleurs

. C'est pour ça qu'un module ou un logiciel ne se désinstalle pas juste en supprimant un répertoire. Ce que tu peux faire, c'est de reinstaller avec fink puis de desintaller avec tous les modules en question. Histoire de voir si au moins tout est bien désinstaller.

Je sais pas s'il existe une option --purge avec fink !!

**zaboug** · 15/06/2009, 15h00

bon, c'est un bazarre monstrueux : pour purger fink, il faut que je le réinstalle (vu que supprimer /sw supprime fink, je retrouve pas où est ce que j'ai lu ça, mais c'est quelque part dans la doc de fink)
sauf que je ne peux pas le faire car

Vous ne pouvez pas installer Fink sur ce volume. Impossible de tester les liens symboliques sur ce volume en raison d'un problème d'autorisation. Lancez la fonction "Réparer les autorisations du disque" de l'application Utilitaire de disque.

je viens de lancer le "Réparer les autorisations du disque", mais ça ne marche toujours pas.

en parallele, cpan refuse d'installer DBD::Mysql

et le module GD.pm n'est même plus trouvé!

Bref, c'est la

j'essaie de remettre un peu d'ordre dans tout ça, et je reviens dire ce qu'il en est.

Moralité : quand un truc marche, même si c'est pas super propre, vaut des fois mieux laisser comme c'est...

**djibril** · 15/06/2009, 15h11

Envoyé par zaboug

Moralité : quand un truc marche, même si c'est pas super propre, vaut des fois mieux laisser comme c'est...

Pas d'accord avec cette phrase.

Je dirais plutôt, quand on veut désinstaller un module ou un logiciel, lire la doc pour trouver l'utilitaire le faisant proprement et ne surtout jamais supprimé le répertoire à l'arrache

.

Dit toi que c'est un mal pour un bien, au moins, tout sera plus clean et propre la prochaine fois.

Courage

**zaboug** · 15/06/2009, 15h14

bon, j'ai réussi à installer le module GD, il est bien trouvé tout va bien.

Je n'ai pas réinstallé Fink, et je ne vais pas essayé pour l'instant, on remettra cette prise de tête à plus tard.
Cela dit, je sais maintenant pourquoi j'avais installé fink : pour pouvoir installer le module DBD::mysql. J'arrive pas à l'installer avec cpan, c'est infernal. M'enfin, je vais bien finir par y arriver !!!

a priori, DBD est le dernier module à installer pour que mon script marche... (enfin j'espère

)

**zaboug** · 15/06/2009, 15h16

Envoyé par djibril

Pas d'accord avec cette phrase.

Je dirais plutôt, quand on veut désinstaller un module ou un logiciel, lire la doc pour trouver l'utilitaire le faisant proprement et ne surtout jamais supprimé le répertoire à l'arrache

.

Dit toi que c'est un mal pour un bien, au moins, tout sera plus clean et propre la prochaine fois.

Courage

je t'assure que la première fois que j'ai désinstaller Fink, j'ai lu dans la doc qu'il suffisait de supprimer ce répertoire :

http://www.finkproject.org/faq/usage...php?phpLang=fr
tu trouveras la réponse à la question : Q.5.6: Comment désinstaller Fink complètement ?

le seul truc que j'ai oublié cette fois ci, c'est le f : j'ai fait

Code :

Sélectionner tout - Visualiser dans une fenêtre à part

sudo rm -r /sw

au lieu de

Code :

Sélectionner tout - Visualiser dans une fenêtre à part

sudo rm -rf /sw

**djibril** · 15/06/2009, 15h21

le f permet juste à unix de te demander confirmation.

Bon courage, tu y arriveras

**zaboug** · 15/06/2009, 15h32

bon, j'ai compris pourquoi l'installation de DBD marche pas:

Code :

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mathilde@cgmc134:~$ mysql -V
mysql  Ver 14.12 Distrib 5.0.67, for apple-darwin9.4.0 (powerpc) using readline 5.1

j'ai une version de mysql pour PPC alors que maintenant j'ai un iMac... (l'administrateur système de mon labo m'a échangé mon PPC contre un iMac, et a transféré ma session sur l'iMac, sauf qu'il y a quelques truc, comme MySQL visiblement, qui n'ont pas fait le passage...

)

**zaboug** · 15/06/2009, 16h50

bon, j'ai installé la bonne version mysql de mysql et j'ai pu installer DBD::MySQL via cpan

mon script marche toujours pas, mais cette fois c'est à cause du module PHP::Session qui ne marche qu'avec Php4 visiblement... Plus qu'à installer php4 à la place de php5

**djibril** · 15/06/2009, 17h14

chemin d'un module présent dans @INC mais pas trouvé par un script

Modules Perl

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