[Sondage] Une FAQ Bioinfo et des tutoriaux

GLDavid · 19/12/2006, 10h36

Bonjour et bienvenue sur le forum Bioinformatique de developpez.com

Ce forum a été récemment ouvert au sein de la rubrique générale Perl. Pourquoi ? Parce que la bioinformatique devient de plus en plus un paramètre improtant de la stratégie des industriels biotechnologiques et/ou pharmacologiques, ceux-ci requièrent de plus en plus des personnes capables de comprendre un problème biologique et de trouver une solution informatique. Ce forum est un sous-forum de la rubrique Perl car Perl est le langage le plus communément utilisé par les bioinformaticiens de la recherche fondamentale ou appliquée.

L'objet de ce sondage est de savoir si vous êtes intéressé (en qualité d'étudiant ou d'actif dans le monde du travail) par une FAQ et des tutoriaux sur cet univers qu'est la bioinformatique. De même, les suggestions sur ce forum seront particulièrement appréciés.

En vous remerciant d'avance d'émettre vos opinions.

@++

Gnux · 20/12/2006, 21h29

Oui oui je veux, surtout si c'est toi qui les fait

Woufeil · 20/12/2006, 21h53

Parrain président, parrain président !

Bon, plus constructif l'avis

Je pense que la biologie est une science passionnante, malheureusement méconnue des informaticiens, et que cette FAQ et ces cours les aiderait à mieux la cerner et l'apprécier.

Je pense aussi que ce forum est fréquenté par pas mal de bioinformaticiens de métier qui pourrait bien avoir besoin de cours sur le domaine.

Et je pense que j'aimerais bien lire des choses sur le domaine... Ca fait un an et demi que j'ai pas fait de biologie (pour un ancien S SVT spé SVT, ça le fait pas

) et j'aimerais bien revoir deux trois trucs, en introduisant l'informatique (et surtout Perl) en plus.

Donc, pour, pour et repour

GLDavid · 21/12/2006, 09h25

Ok, alors je vois ce que je pourrais faire comme cours de bioinfo.
Attention, j'avertis d'entrée de jeu, pas question de faire à 100% de la bioinformatique fondamentale. Mon propos sera accès avec l'univers professionnel.
Je vois bien un petit rappel de quelques notions de biologie, biologie moléculaire et on attaque avec les outils utilisés en bioinformatique et l'introduction des langages comme Perl ou Java pour scripter ou pour voir quelques algorithmes.
Qu'en pensez-vous ?

@++

GLDavid · 21/12/2006, 09h25

Tiens, il y en a un qui a voté non. Cette personne peut il nous dire pourquoi ?

@++

Woufeil · 21/12/2006, 15h40

Citation:

Envoyé par GLDavid

Tiens, il y en a un qui a voté non. Cette personne peut il nous dire pourquoi ?

@++

Je pense qu'il a dit non parce que ça l'intéresse pas tout simplement

GLDavid · 21/12/2006, 16h02

Oki !

De toute façon, ce serait anormal si tout le monde était d'accord.

@++

Leishmaniose · 21/12/2006, 18h11

Code :

Sélectionner tout - Visualiser dans une fenêtre à part

$Sous_forum_bioinfo .= "tutoriaux" . "FAQ";

Je vois ça comme une suite logique...

Notez que les communautés d'internautes bioinformaticiens manquent cruellement sur la toile, n'en parlant pas de celles qui sont francophones.

Pour ma part, mon enregistrement sur ce forum de développeur (déjà 3 ans auparavant) était justement pour résoudre des problèmes info. traitant de la bio. et croyez moi que j'espèrais de tout coeur voir un jour une rubrique bioinfo. sur developpez.com et finalement c'est ce qui s'est passé et voila maintenant que ça se dévoloppe

GLDavid · 22/12/2006, 09h01

Cher Leishmaniose

Ta succession d'idées me plaît bien et j'avais envie d'appliquer cela.
Il est clair que la bioinfo se développe et n'en déplaise à ses détracteurs, un site qui prétend traiter de l'informatique en général, se doit aussi de traiter de la bioinformatique.
Commencer par les tutoriaux me semble bien. Elle permettra ensuite de reprendre des idées maîtresses en résumé pour une FAQ.

Merci de ton opinion.

@++

stoyak · 31/12/2006, 18h28

ok également pour l'idee ... le sujet étant tellement vaste qu'il me semble nécessaire de commencer par quelque chose de simple et de bien balisé.
peut-être en commençant par l'analyse de séquence nucléique ou protéique, transcription, traduction? ça permettrait d'avoir les concepts bio de base et une utilisation de perl ou java directe, en utilisant ou non les modules Bio::Perl.

voilà ma petite contribution à la discussion!;)

mobscene · 03/01/2007, 03h49

Heu pourquoi ne pas développer un séquenceur en perl ?

Leishmaniose · 08/01/2007, 10h48

Citation:

Envoyé par mobscene

Heu pourquoi ne pas développer un séquenceur en perl ?

J'exige des précisions !!!

scaleo · 18/01/2007, 00h41

Citation:

Envoyé par mobscene

Heu pourquoi ne pas développer un séquenceur en perl ?

Hein

mobscene · 22/01/2007, 02h40

Citation:

Envoyé par Leishmaniose

J'exige des précisions !!!

Bah pogrammer un séquenceur génétique en pel

Leishmaniose · 22/01/2007, 15h13

Citation:

Envoyé par mobscene

Bah pogrammer un séquenceur génétique en pel

Je n'arrive toujours pas à saisir le fond de ta pensée. Est ce que tu veux dire développer un programme en perl pour la gestion d'un séquenceur ADN ??? Sinon c'est quoi un séquenceur génétique

mobscene · 22/01/2007, 21h18

Citation:

Envoyé par Leishmaniose

Je n'arrive toujours pas à saisir le fond de ta pensée. Est ce que tu veux dire développer un programme en perl pour la gestion d'un séquenceur ADN ??? Sinon c'est quoi un séquenceur génétique

Bah par exemple tu donne au programme un séquence ADN lui il établie une carte génomique, il peut aussi a partir de cette carte et des bases de données dispo dans certaines université te dire a qu'elle espèce appartient la séquence d'ADN en question etc...

faudrait que le programme remplace tout ce que tu vois la

, bref un truc de dingue

http://ead.univ-angers.fr/~jaspard/P...termSeqNUC.htm

Tygrou · 02/02/2007, 10h09

Voila une très bonne idée ç'est par où qu'on s'inscrit ?

minus · 05/03/2007, 12h20

Un petit coucou chers collègues de cette matière si peu connue :p

Les sites sur la programmation en bioinfo sont rares... et encore plus quand il s'agit de sites français... c'est dejà un réel plaisir de voir un forum sur ce sujet sur developpez, alors si en plus on peux faire une FAQ je vote pour bien sur

A quand les tutos?

djibril · 05/03/2007, 13h08

c'est bien que cela intéresse pas mal de personnes. On est sur une bonne voix.
En tout cas, s'il y a des personnes parmis vous prêt à filer un coup de main, ayant des idées sur les sujets à traiter, à mettre en place dans la FAQ, n'hésitez pas à contacter Woufeil, GLDavid et moi.

Merci de votre participation!!

Mayeu · 05/04/2007, 11h56

Bonjour,

J'ai vu que le sondage étais un peu vieux, mais j'ai quand même ajouté ma voix pour dire que je suis entièrememt pour!

Salutation

Mayeu

19/12/2006, 10h36	#1
GLDavid Membre Expert Inscription : janvier 2003 Messages : 2 667 Détails du profil Informations personnelles : Âge : 36 Informations forums : Inscription : janvier 2003 Messages : 2 667 Points : 2 487 Points : 2 487	[Sondage] Une FAQ Bioinfo et des tutoriaux Bonjour et bienvenue sur le forum Bioinformatique de developpez.com Ce forum a été récemment ouvert au sein de la rubrique générale Perl. Pourquoi ? Parce que la bioinformatique devient de plus en plus un paramètre improtant de la stratégie des industriels biotechnologiques et/ou pharmacologiques, ceux-ci requièrent de plus en plus des personnes capables de comprendre un problème biologique et de trouver une solution informatique. Ce forum est un sous-forum de la rubrique Perl car Perl est le langage le plus communément utilisé par les bioinformaticiens de la recherche fondamentale ou appliquée. L'objet de ce sondage est de savoir si vous êtes intéressé (en qualité d'étudiant ou d'actif dans le monde du travail) par une FAQ et des tutoriaux sur cet univers qu'est la bioinformatique. De même, les suggestions sur ce forum seront particulièrement appréciés. En vous remerciant d'avance d'émettre vos opinions. @++ __________________ GLDavid Consultez la FAQ Perl ainsi que mes cours de Perl. N'oubliez pas les balises code ni le tag Je ne répond à aucune question technique par MP.
	00

20/12/2006, 21h53	#3
Woufeil Rédacteur Étudiant Inscription : février 2006 Messages : 1 076 Détails du profil Informations personnelles : Âge : 25 Localisation : France, Haute Garonne (Midi Pyrénées) Informations professionnelles : Activité : Étudiant Informations forums : Inscription : février 2006 Messages : 1 076 Points : 2 080 Points : 2 080	Parrain président, parrain président ! Bon, plus constructif l'avis Je pense que la biologie est une science passionnante, malheureusement méconnue des informaticiens, et que cette FAQ et ces cours les aiderait à mieux la cerner et l'apprécier. Je pense aussi que ce forum est fréquenté par pas mal de bioinformaticiens de métier qui pourrait bien avoir besoin de cours sur le domaine. Et je pense que j'aimerais bien lire des choses sur le domaine... Ca fait un an et demi que j'ai pas fait de biologie (pour un ancien S SVT spé SVT, ça le fait pas ) et j'aimerais bien revoir deux trois trucs, en introduisant l'informatique (et surtout Perl) en plus. Donc, pour, pour et repour __________________ "En essayant continuellement, on finit par réussir. Donc : plus ça rate, plus on a de chances que ça marche" (devise Shadock) Application : ainsi qu'à regarder la avant de poser une question. La rubrique Perl recrute, contactez-moi.
	00

21/12/2006, 09h25	#4
GLDavid Membre Expert Inscription : janvier 2003 Messages : 2 667 Détails du profil Informations personnelles : Âge : 36 Informations forums : Inscription : janvier 2003 Messages : 2 667 Points : 2 487 Points : 2 487	Ok, alors je vois ce que je pourrais faire comme cours de bioinfo. Attention, j'avertis d'entrée de jeu, pas question de faire à 100% de la bioinformatique fondamentale. Mon propos sera accès avec l'univers professionnel. Je vois bien un petit rappel de quelques notions de biologie, biologie moléculaire et on attaque avec les outils utilisés en bioinformatique et l'introduction des langages comme Perl ou Java pour scripter ou pour voir quelques algorithmes. Qu'en pensez-vous ? @++ __________________ GLDavid Consultez la FAQ Perl ainsi que mes cours de Perl. N'oubliez pas les balises code ni le tag Je ne répond à aucune question technique par MP.
	00

21/12/2006, 09h25	#5
GLDavid Membre Expert Inscription : janvier 2003 Messages : 2 667 Détails du profil Informations personnelles : Âge : 36 Informations forums : Inscription : janvier 2003 Messages : 2 667 Points : 2 487 Points : 2 487	Tiens, il y en a un qui a voté non. Cette personne peut il nous dire pourquoi ? @++ __________________ GLDavid Consultez la FAQ Perl ainsi que mes cours de Perl. N'oubliez pas les balises code ni le tag Je ne répond à aucune question technique par MP.
	00

21/12/2006, 16h02	#7
GLDavid Membre Expert Inscription : janvier 2003 Messages : 2 667 Détails du profil Informations personnelles : Âge : 36 Informations forums : Inscription : janvier 2003 Messages : 2 667 Points : 2 487 Points : 2 487	Oki ! De toute façon, ce serait anormal si tout le monde était d'accord. @++ __________________ GLDavid Consultez la FAQ Perl ainsi que mes cours de Perl. N'oubliez pas les balises code ni le tag Je ne répond à aucune question technique par MP.
	00

20/12/2006, 21h29	#2
Gnux Membre Expert Inscription : juillet 2003 Messages : 2 066 Détails du profil Informations forums : Inscription : juillet 2003 Messages : 2 066 Points : 2 121 Points : 2 121	Oui oui je veux, surtout si c'est toi qui les fait
	00

21/12/2006, 18h11	#8
Leishmaniose Membre régulier Inscription : novembre 2003 Messages : 143 Détails du profil Informations personnelles : Localisation : Tunisie Informations forums : Inscription : novembre 2003 Messages : 143 Points : 85 Points : 85	Code : Sélectionner tout - Visualiser dans une fenêtre à part $Sous_forum_bioinfo .= "tutoriaux" . "FAQ"; Je vois ça comme une suite logique... Notez que les communautés d'internautes bioinformaticiens manquent cruellement sur la toile, n'en parlant pas de celles qui sont francophones. Pour ma part, mon enregistrement sur ce forum de développeur (déjà 3 ans auparavant) était justement pour résoudre des problèmes info. traitant de la bio. et croyez moi que j'espèrais de tout coeur voir un jour une rubrique bioinfo. sur developpez.com et finalement c'est ce qui s'est passé et voila maintenant que ça se dévoloppe
	00

22/12/2006, 09h01	#9
GLDavid Membre Expert Inscription : janvier 2003 Messages : 2 667 Détails du profil Informations personnelles : Âge : 36 Informations forums : Inscription : janvier 2003 Messages : 2 667 Points : 2 487 Points : 2 487	Cher Leishmaniose Ta succession d'idées me plaît bien et j'avais envie d'appliquer cela. Il est clair que la bioinfo se développe et n'en déplaise à ses détracteurs, un site qui prétend traiter de l'informatique en général, se doit aussi de traiter de la bioinformatique. Commencer par les tutoriaux me semble bien. Elle permettra ensuite de reprendre des idées maîtresses en résumé pour une FAQ. Merci de ton opinion. @++ __________________ GLDavid Consultez la FAQ Perl ainsi que mes cours de Perl. N'oubliez pas les balises code ni le tag Je ne répond à aucune question technique par MP.
	00

31/12/2006, 18h28	#10
stoyak Rédactrice/Modératrice Inscription : juin 2005 Messages : 391 Détails du profil Informations forums : Inscription : juin 2005 Messages : 391 Points : 1 147 Points : 1 147	ok également pour l'idee ... le sujet étant tellement vaste qu'il me semble nécessaire de commencer par quelque chose de simple et de bien balisé. peut-être en commençant par l'analyse de séquence nucléique ou protéique, transcription, traduction? ça permettrait d'avoir les concepts bio de base et une utilisation de perl ou java directe, en utilisant ou non les modules Bio::Perl. voilà ma petite contribution à la discussion!;) __________________ Cela demande du courage d'en tirer du plaisir Quand on n'a qu'un marteau, tous les problèmes ressemblent à un clou
	00

03/01/2007, 03h49	#11
mobscene Membre actif Inscription : avril 2005 Messages : 331 Détails du profil Informations forums : Inscription : avril 2005 Messages : 331 Points : 178 Points : 178	Heu pourquoi ne pas développer un séquenceur en perl ?
	00

02/02/2007, 10h09	#17
Tygrou Membre à l'essai Inscription : avril 2006 Messages : 38 Détails du profil Informations forums : Inscription : avril 2006 Messages : 38 Points : 21 Points : 21	Voila une très bonne idée ç'est par où qu'on s'inscrit ?
	00

05/03/2007, 12h20	#18
minus Membre actif Inscription : juin 2005 Messages : 153 Détails du profil Informations personnelles : Âge : 29 Localisation : France, Bouches du Rhône (Provence Alpes Côte d'Azur) Informations forums : Inscription : juin 2005 Messages : 153 Points : 161 Points : 161	Un petit coucou chers collègues de cette matière si peu connue :p Les sites sur la programmation en bioinfo sont rares... et encore plus quand il s'agit de sites français... c'est dejà un réel plaisir de voir un forum sur ce sujet sur developpez, alors si en plus on peux faire une FAQ je vote pour bien sur A quand les tutos? __________________ Science sans conscience n'est que ruine de l'âme
	00

05/03/2007, 13h08	#19
djibril Responsable Perl et Outils Inscription : avril 2004 Messages : 13 487 Détails du profil Informations personnelles : Sexe : Âge : 33 Localisation : France Informations forums : Inscription : avril 2004 Messages : 13 487 Points : 31 589 Points : 31 589	c'est bien que cela intéresse pas mal de personnes. On est sur une bonne voix. En tout cas, s'il y a des personnes parmis vous prêt à filer un coup de main, ayant des idées sur les sujets à traiter, à mettre en place dans la FAQ, n'hésitez pas à contacter Woufeil, GLDavid et moi. Merci de votre participation!! __________________ QUIZZ, Tutoriels, FAQ de la rubrique Perl ; Compte Twitter de la rubrique Perl. Pas de questions technique par messagerie privée (lisez les règles du forum Perl) et pour les nouveaux !
	00

05/04/2007, 11h56	#20
Mayeu Futur Membre du Club Étudiant Inscription : janvier 2007 Messages : 57 Détails du profil Informations personnelles : Âge : 26 Informations professionnelles : Activité : Étudiant Informations forums : Inscription : janvier 2007 Messages : 57 Points : 18 Points : 18	Bonjour, J'ai vu que le sondage étais un peu vieux, mais j'ai quand même ajouté ma voix pour dire que je suis entièrememt pour! Salutation Mayeu
	00

Outils de la discussion
Afficher une version imprimable Envoyer un lien vers cette page par email