Discussion :

[icebreaked]

Bonjour à tous et à toutes !!

Alors voilà j'ai ce message d'erreur qui s'affiche dans mon terminal :

Invalid [] range "l-c" in regex; marked by <-- HERE in m/3-oxoacyl-[acyl-c <-- HERE arrier-protein] synthase 2/ at ./enriched_hash.pl line 128, <FICHIER> line 5586.

C'est tout à fait normal puisque dans une chaîne de caractère il y a la présence de crochets. Voici cette chaîne de caractères :
3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] synthase 2

Et voici la comparaison que je fais :
unless ( $$ref_hash{$line[0]}{'function'} =~ m/$line[12]/) {

... instructions ...

}

$line[12] correspond à ma chaîne de caractères. Je vérifie si ma table de hashage contient cette chaîne de caractère. Mais le soucis c'est que cette chaîne contient
un métacaractère.

Comment je peux le supprimer ? Et sinon l'alternative est comment je peux passer outre ce problème ?
J'imagine qu'il faut bien que j'utilise un backslash mais comment ?

si vous avez besoin de plus d'infos pour que je puisse résoudre mon problème, dites le moi

Merci par avance de vos réponses

[Lolo78]

Bonjour,

si tu as des crochets dans ta regex, ils sont considérés comme contenant une classe de caractères et, dans une classe de caractères, un tiret ("-") indique un intervalle de chiffres ou de lettres. Et "l-c" n'est pas un intervalle valide.

Il faut préfixer les crochets (ou, du moins, le crochet ouvrant) par un backslash:

Code :

Sélectionner tout - Visualiser dans une fenêtre à part

1
2
 
/3-oxoacyl-\[acyl-carrier-protein\] synthase 2/

Il existe une fonction Perl qui ajoute les backshlashes partout où c'est nécessaire dans une chaîne de caractère: quotemeta (http://perldoc.perl.org/functions/quotemeta.html), si bien que tu n'as pas besoin de le faire toi-même.

Tu peux également essayer les balises \Q et \E:

Code :

Sélectionner tout - Visualiser dans une fenêtre à part

1
2
 
/\Q3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] synthase 2\E/

Cela dit, comme tu as l'air de faire une recherche littérale de sous-chaîne, l'utilisation de la fonction index est sans doute préférable.

[icebreaked]

Encore merci pour ta réponse rapide

J'ai regardé ce que tu m'as conseillé, et c'est pas mal du tout !

Merci encore !