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R

  1. #1
    Membre à l'essai
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    Par défaut lire tous les fichiers d'un dossier
    Bonjour tout le monde,
    Je souhaiterais réaliser un script R qui permet d'écrire tous les fichiers fasta d'un dossier (fasta_seq) dans un seul fichier.

    J'ai utilisé ce code mais il ne fonctionne pas
    Code : Sélectionner tout - Visualiser dans une fenêtre à part
    1
    2
    3
    4
    5
    6
     
     install.packages("seqinr")
     
    library("seqinr")
     
    sequence  = read.fasta(file = "./fasta_seq/")
    Merci à vous

  2. #2
    Membre éclairé Avatar de Matthieu76
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    890
    Par défaut
    Essaye ça :
    Code : Sélectionner tout - Visualiser dans une fenêtre à part
    sequence  = read.fasta(file = "./fasta_seq/*")
    Je suis pas du tout sûr que cela fonctionne mais on sait jamais ^^

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