Discussion :

[dotbaille]

Bonjour,
je commence à débuter avec imagej (même plutôt Fiji en fait), que je dois utiliser pour analyser des images de microscopie.
En pratique, j'ai 2 images à 2 longueurs d'onde d'excitation différentes d'un même champs pour visualiser l'état d'oxydo-réduction d'une protéine. Pour analyser ces données, je dois (après avoir ajuster les brillances, contrastes...) diviser l'image obtenue à une longueur d'onde (405nm, prot oxydée) par l'image obtenue à la seconde longueur d'onde (491nm, prot réduite). Je mesure alors le niveau d'oxydo-réduction en faisant un "plot Z-axis" sur la ROI où est localisée ma protéine. Cependant, je voudrais pouvoir "calibrer" ce système. Pour le moment, si je veux visualiser des changements d'états de cette protéine, l'amplitude des changement d'intensité du ration est très limitée. Je peux expérimentalement oxyder ou réduire au maximum cette protéine par l'ajout de produits chimiques, mais je ne vois pas du tout comment ensuite exploiter les valeurs ainsi obtenues pour calibrer mon analyse d'image. Je voudrais pouvoir entrer ma valeur maximale d'oxydation d'une part, de réduction d'autre part, et enregistrer ces valeurs comme ... intervalle d'intensité des pixels...?
Je suis désolée de l'imprécision de ma question, je suis bien consciente qu'elle est tout sauf clair (puisque le problème n'est déjà pas du tout clair dans ma tête!!), mais toute suggestion, remarque, commentaire serait bienvenu!
Merci d'avance;
dotbaille.

[ToTo13]

je commence à débuter avec imagej (même plutôt Fiji en fait)

Fiji Is Just ImageJ (FIJI)

Peux tu nous montrer les images d'origines afin d'illustrer ce que tu expliques ? Ce sera beaucoup plus simple à comprendre.