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R Discussion :

Trait de côte avec ggplot et calcul de distance


Sujet :

R

  1. #1
    Membre actif Avatar de habasque
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    Par défaut Trait de côte avec ggplot et calcul de distance
    Bonjour,

    A partir de mon jeu de données (points de mesures effectuées au large des côtes marocaines) je souhaiterais :
    1- Cartographier les points avec des valeurs associées en ajoutant le polygone du continent, en distinguant les mesures de jour et de nuit.
    2- Calculer la distance entre chaque point et le trait de côte. Ce qui induit d'avoir un polygone à haute résolution.

    Voici un exemple reproductible:

    Code : Sélectionner tout - Visualiser dans une fenêtre à part
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    library(ggplot2)
    library(maptools)
    library(mapdata)
    library(rworldmap)
    lon = c(-16.80,-16.81,-16.82,-16.83,-16.84,-16.85)
    lat = c(22.93,22.91,22.90,22.89,22.87,22.86)
    values = c(1.84,2.06,1.54,1.47,1.48,1.17)
    day_night = c(1,1,1,3,3,3)
    dataset = data.frame(lon,lat,values,day_night)
    maroc.map <- data.frame(map('worldHires', c('Morocco','Western Sahara'))[c('x', 'y')])
    ggplot(maroc.map,aes(x=x,y=y))+ geom_path() +
      geom_point(aes(x=lon, y=lat, color=values),inherit.aes=FALSE,data=dataset,alpha=1, size=2)+
      facet_grid(~day_night)+
      scale_x_continuous(limits = c(min(lon)-0.5,max(lon)+0.5),"Longitude") + scale_y_continuous(limits = c(min(lat)-0.5, max(lat)+0.5),"Latitude")+
      theme_bw()
    Pour le moment, j'utilise la librairie ggplot et worldHires pour le polygone continent. Le résultat n'est pas très satisfaisant car le trait de côte est d'une faible résolution et il est tronqué par geom_path:
    Code : Sélectionner tout - Visualiser dans une fenêtre à part
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    Warning messages:
    1: Removed 141 rows containing missing values (geom_path).
    Y a t-il des librairies / fonctions plus adaptées à mes besoins ? Et je n'ai pas encore abordé le calcul de la distance entre chaque point et le trait de côte...

    Merci d'avance,

  2. #2
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    Par défaut
    Bonjour Abasque,

    Code : Sélectionner tout - Visualiser dans une fenêtre à part
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    longitude = as.numeric(maroc.map[is.na(maroc.map$x)==FALSE,'x'])
    latitude = as.numeric(maroc.map[is.na(maroc.map$x)==FALSE,'y'])
    map<-data.frame(lon,lat)
     
    ggplot(map,aes(x=longitude,y=latitude))+ geom_path() +
      geom_point(aes(x=lon, y=lat, color=values),inherit.aes=FALSE,data=dataset,alpha=1, size=2)+
      facet_grid(~day_night)+
      scale_x_continuous(limits = c(min(lon)-0.5,max(lon)+0.5),"Longitude") + scale_y_continuous(limits = c(min(lat)-0.5, max(lat)+0.5),"Latitude")+
      theme_bw()
    Cordialement.

  3. #3
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    Par défaut
    Merci,
    J'ai toujours le même warning avec l'utilisation de geom_path.
    Et le rendu n'est pas de haute qualité.
    Je me demande si je ne devrais pas passer par une autre librairie ?
    Images attachées Images attachées  

  4. #4
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    Par défaut
    Finalement, je passe par la fonction Rgshhs du package maptools.
    Il faut télécharger le fichier binaire ici http://www.soest.hawaii.edu/pwessel/...-bin-2.3.0.zip puis le dézipper.

    Et ensuite utiliser le code suivant :
    Code : Sélectionner tout - Visualiser dans une fenêtre à part
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    cote<-Rgshhs("C:/Users/.../Desktop/GSHHS/gshhg-bin-2.3.0/gshhs_f.b",xlim=c(X,X),ylim=c(X,X),level=2).
    plot(cote$SP,col="gray70")
    Je n'ai pas trouvé comment utiliser ce trait de côte avec le package ggplot. Ensuite, pour réaliser des graphiques selon un facteur, je passe par des subset que je gère par des layouts.
    Images attachées Images attachées  

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