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R Discussion :

correction de code


Sujet :

R

  1. #1
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    Par défaut correction de code
    Bonjour ;

    s'il vous plaît quelqu'un peut m'aider à corriger ce code
    Code : Sélectionner tout - Visualiser dans une fenêtre à part
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    require(cluster) 
    require(class)
    require(stats)
    library(RWeka)
    require(stringer)
     
    data <- read.table("breast-cancer-wisconsin.data",header=F,sep=",",stringsAsFactors=F)
    head(data)
     
     
    names(data) <- c('id','ct','ucsize','ucshape','ma','secs','bn','bc','nn','miti','class')
    head(data)
    #clean up data
    require(stringr)
    #remove whitespace
    data <-t(apply(data, 1, function(x) {str_replace(x, "\\s+", "")}))
    data <-t(apply(data, 1, function(x) {str_replace(x, "\\D", NA)}))
    #I'm not sure what's the best way to deal with NAs
    #so I'll just remove them
     
    to_numeric <- function(x) as.numeric(as.character(x))
    data <- modifyList(data, lapply(data, to_numeric))
    sapply(data,mode)
    data <- na.omit(data)
    #lost a few data points
    dim(data)
    fit <- kmeans(data[,c(2:10)], 2)
    names(fit)
     
    #k-means did a fairly good job
    table(data.frame(fit$cluster,data[,11]))
    table(data.frame(fit$cluster,data[,11]))
     
     
     
     
    result$withinss  
     
    train = data[c(1:137),] # données à classer
     
    test  = fit$center[,]  # données étiquetée  
     
    cl1 <- factor(c(rep("2",), rep("4",)) 
    pred = knn(train, test,cl1  , k = 1)
     
    table(pred[],class=test[])

    NB:voici les erreures : 1)
    Code : Sélectionner tout - Visualiser dans une fenêtre à part
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    Error: unexpected symbol in:
    "cl1 <- factor(c(rep("2",), rep("4",)) 
    pred"
    et
    Code : Sélectionner tout - Visualiser dans une fenêtre à part
    1
    2
      Error in table(pred[], class = test[]) : 
      tous les arguments doivent avoir la même longueur

    et merci

  2. #2
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    Par défaut
    "Error: unexpected symbol" veut dire qu'il y a un symbole à un endroit où il ne devrait pas ou bien qu'il manque un symbole que R attend. Dans 90% des cas, c'est une erreur d'accolades ou de parenthèses, comme c'est le cas ici.

  3. #3
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    Par défaut
    j'ai vérifié mais c'est correct

  4. #4
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    Par défaut
    voici une autre version de code quelqu'un peu m'aider et merci


    Code : Sélectionner tout - Visualiser dans une fenêtre à part
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    require(cluster) 
    require(class)
    require(stats)
    library(RWeka)
    require(stringr)
     
    data <- read.table("http://archive.ics.uci.edu/ml/machine-learning-databases/breast-cancer-wisconsin/breast-cancer-wisconsin.data",sep=",")
    head(data)
    names(data) <- c('id','ct','ucsize','ucshape','ma','secs','bn','bc','nn','miti','class')
    head(data)
     
    #clean up data
    require(stringr)
    #remove whitespace
    data <-t(apply(data, 1, function(x) {str_replace(x, "\\s+", "")}))
    data <-t(apply(data, 1, function(x) {str_replace(x, "\\D", NA)}))
    #I'm not sure what's the best way to deal with NAs
    #so I'll just remove them
    data <- na.omit(data)
    #but everything is converted into characters
    head(data)
    data <- as.data.frame(data, stringsAsFactors=F)
    #transform them back to numeric
    #define function
    to_numeric <- function(x) as.numeric(as.character(x))
    data <- modifyList(data, lapply(data, to_numeric))
    sapply(data,mode)
    fit <- kmeans(data[,c(2:10)], 2)
    names(fit)
     
    #k-means did a fairly good job
    table(data.frame(fit$cluster,data[,11]))
     
    fit$center
     
    train = data[1:137,1:10] # données à classer
     
    test  = result$center[]  # données étiquetée  
     
    cl <- factor(c(rep("2",), rep("4",)))
     
    pred = knn(train, test,cl  , k = 2)
     
    table(pred[],=test[,11])

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