Bonjour à tous , je suis novice dans python , mais je souhaite vraiment progresser , mon fichier est de type , et je souhaiterai le parser pour en sortir un fichier de sortie sous forme de tableau ,
seulement je n'ai pour le moment les outils que pour le lire , le decouper , mais je n'arrive pas à realiser et a bien raisonner pour sortir le resultat voulu ,
mon fichier de depart est de ce type : ce que j'essaye de faire est de recuperer les molecules dans chaque bloc , 1QMF 1X7Z........etc il y'en a 7 et afficher en correspondance guanidinium les recuperer avec les acides amines et leurs valeurs mais j'y arrive pas
1QMF: PEPTIDOGLYCAN SYNTHESIS - PENICILLIN-BINDING PROTEIN 2X (PBP-2X)
ACYL-ENZYME COMPLEX
1QMF: PEPTIDOGLYCAN SYNTHESIS - PENICILLIN-BINDING PROTEIN 2X (PBP-2X)
ACYL-ENZYME COMPLEX
corrected number of sumo groups = (3.22631, 3.22631)
number of PDB groups = (4, 4)
patch radius = (3.71683, 3.71683)
score = 3.22631
rmsd = 0
penalty = 0
guanidinium ARG 426 A {1.0} 0.00 0.000
ARG 426 A
hyd_ali [cd] ARG 426 A {0.6} 0.00 0.000
[cd] ARG 426 A
bb [backbone] GLY 647 A {0.5} 0.00 0.000
[backbone] GLY 647 A
hyd_ali ALA 650 A {0.6} 0.00 0.000
ALA 650 A
hyd_ali [cbcg2] VAL 662 A {0.6} 0.00 0.000
[cbcg2] VAL 662 A
------------------------------------------------------------------------------
1QMF: PEPTIDOGLYCAN SYNTHESIS - PENICILLIN-BINDING PROTEIN 2X (PBP-2X)
ACYL-ENZYME COMPLEX
1X7Z: OXIDOREDUCTASE - CRYSTAL STRUCTURE OF THE HUMAN MITOCHONDRIAL
BRANCHED-CHAIN KETOACID DEHYDROGENASE
number of sumo groups = 2.1201
corrected number of sumo groups = (2.1201, 2.1201)
number of PDB groups = (3, 3)
patch radius = (3.01092, 3.26716)
score = 2.1201
rmsd = 0
penalty = 0.0582108
guanidinium ARG 426 A {1.0} 0.21 0.046
ARG 220 A
Partager