Discussion :

[Slumpy]

Bonjour,

Mon problème est trivial, néanmoins cela fait bien 3 heures que je suis coincé dessus ...

J'ai plusieurs csv que je souhaite lire. Étant novice en R, j'ai cherché sur internet comment faire cela, et je me suis inspiré d'un exemple de code que j'ai trouvé. Adapté à mon cas, cela donne :

Code :

Sélectionner tout - Visualiser dans une fenêtre à part

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rm(list=ls())
##Read files
filenames <- list.files(path="C:/test",
                        pattern=".*csv")
 
##Create list of data frame names without the ".csv" part 
names <-substr(filenames,1,nchar(filenames)-4)
 
###Load all files
for(i in names){
  filepath <- file.path("C:/test/",paste(i,".csv",sep=""))
  assign(i, read.table(filepath,skip = 21,na.strings="---",
                       colClasses=c("character","numeric",rep("character",2)),
                       sep = ","))
 
}

Si je comprends bien, d'un côté, j'ai une liste "names" qui ne contient pas les objets lus, mais seulement les noms (i.e. strings) des fichiers, (liste names) et a côté de cela j'ai un objet par fichier qui porte le nom du fichier qui, lui, contient les données.

Si j'ai bien compris, je peux les récupérer et les consulter avec get(). Par exemple, pour récupérer la seconde colonne du premier fichier, je peux utiliser :

Code :

Sélectionner tout - Visualiser dans une fenêtre à part

get(names[1])[2]

Mon problème est que j'ai l impression que si je peux lire les données, je ne peux pas les modifier (style éliminer les valeurs NA). Je me suis peut-être trompé dans la syntaxe, mais le code suivant ne fonctionne pas :

Code :

Sélectionner tout - Visualiser dans une fenêtre à part

get(names[1])[is.na(get(names[1]))] <-0

De plus, ça n'a pas l air super pratique de se trainer ce get() à toutes les sauces.

Bref, je voudrais donc que durant ma lecture des données, j'obtienne une liste contenant les objets eux-mêmes. Je pense que cela sera plus simple pour la suite. Mais helas, je ne vois pas comment faire cela.

Une âme charitable pourrait m'aider svp ?

Merci

Slumpy.

[A. D.]

Bonjour,

Mon message ne répond pas entièrement à vos questions, mais pour contourner le problème des "assign" et compagnie, pourquoi ne pas passer par une liste ?
Vous créez une liste avec autant d'éléments que de fichiers csv à charger dans R, et vous utilisez votre boucle pour charger ces différents fichiers.

HTH !

Bonne continuation


Cordialement,


A.D.

[Slumpy]

Salut, et merci d'avoir pris le temps de répondre.

Effectivement, le code ci-dessous resout bien mon problème, puisque je me retrouve avec une liste "my_list" qui contient mes objets, avec leur nom associé. Comme un âne, j'ai suivi l'exemple que j'avais lu sur un autre site et étais donc parti dans la mauvaise direction.

Merci !

Slumpy

Code :

Sélectionner tout - Visualiser dans une fenêtre à part

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rm(list=ls())
##Read files
filenames <- list.files(path="C:/test",
                        pattern=".*csv")
 
##Create list of data frame names without the ".csv" part 
my_names <-substr(filenames,1,nchar(filenames)-4)
 
###Load all files
my_list <- vector("list", length(my_names))
for(i in 1:length(my_names)){ 
  filepath <- file.path("C:/test/",paste(my_names[i],".csv",sep=""))
  my_list[[i]] <- read.table(filepath,skip = 21,na.strings="---",
                       colClasses=c("character","numeric",rep("character",2)),
                       sep = ",")
}  
 
names(my_list) <- my_names