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#1 |
Étudiant Inscription : février 2013 Messages : 3 ![]() |
Bonjour ts le monde,
j'ai une sequence inconnue, et jai un exercice à faire dont il faut trouve l'origine de celle ci et aussi sa carte ( en réalité jai 2 sequences), aprés il faut trouver l'Orf et sa carte???? ts cela il faut l'appliquer en NCBI. je veux bien que vous m'aidez, pour savoir les etapes necessaires. bon voila les 2 sequences 1. CTGACGCGCCCTGTAGCGGCGCATTAAGCGCGGCGGGTGTGGTGGTTACGCGCAGCGTGA CCGCTACACTTGCCAGCGCCCTAGCGCCCGCTCCTTTCGCTTTCTTCCCTTCCTTTCTCG CCACGTTCGCCGGCTTTCCCCGTCAAGCTCTAAATCGGGGGCTCCCTTTAGGGTTCCGAT TTAGTGCTTTACGGCACCTCGACCCCAAAAAACTTGATTAGGGTGATGGTTCACGTAGTG GGCCATCGCCCTGATAGACGGTTTTTCGCCCTTTGACGTTGGAGTCCACGTTCTTTAATA GTGGACTCTTGTTCCAAACTGGAACAACACTCAACCCTATCTCGGTCTATTCTTTTGATT TATAAGGGATTTTGCCGATTTCGGCCTATTGGTTAAAAAATGAGCTGATTTAACAAAAAT TTAACGCGAATTTTAACAAAATATTAACGCTTACAATTTCCATTCGCCATTCAGGCTGCG CAACTGTTGGGAAGGGCGATCGGTGCGGGCCTCTTCGCTATTACGCCAGCTGGCGAAAGG GGGATGTGCTGCAAGGCGATTAAGTTGGGTAACGCCAGGGTTTTCCCAGTCACGACGTTG TAAAACGACGGCCAGTGAGCGCGCGTAATACGACTCACTATAGGGCGAATTGGGTACCGG GCCCCCCCTCGAGGTCGACGGTATCGATAAGCTTGATATCGAATTCCTGCAGCCCGGGGG ATCCACTAGTTCTAGAGCGGCCGCCACCGCGGTGGAGCTCCAGCTTTTGTTCCCTTTAGT GAGGGTTAATTGCGCGCTTGGCGTAATCATGGTCATAGCTGTTTCCTGTGTGAAATTGTT ATCCGCTCACAATTCCACACAACATACGAGCCGGAAGCATAAAGTGTAAAGCCTGGGGTG CCTAATGAGTGAGCTAACTCACATTAATTGCGTTGCGCTCACTGCCCGCTTTCCAGTCGG 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ACAGTAATTACGGTGCTGCGCTGGAGAAACAGGGTGTGGAAATCACGCTGATTTACAGCGGCAGCCATA et merci pour vous |
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#2 |
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Membre Expert
![]() Laurent R.Conseil - Consultant en systèmes d'information Inscription : mai 2012 Messages : 588 ![]() |
Bonjour,
as-tu commencé à coder quelque chose? Ce serait bien que tu le montres.
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Sauf mention contraire explicite, les bouts de code que je poste en réponse à une question n'ont pas forcément été testés. |
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#3 |
Étudiant Inscription : février 2013 Messages : 3 ![]() |
jai aucune idéé pour commencer, comment je peux trouver une solution sachant que on a pas fait un TP et en plus on a fait juste 4h de cours, c à vous d'imaginer ma situation!!!
merci pour la reponse |
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#4 | |
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Membre éprouvé
![]() Inscription : avril 2007 Messages : 749 ![]() |
Citation:
Personne ne fera ton exercice à ta place. Commence par expliquer ce que tu n'arrives pas à faire. |
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#5 |
Étudiant Inscription : février 2013 Messages : 3 ![]() |
d'accord!!!! ce qui concerne l'origine d'une sequence???
est ce que, pour le cas de mes 2 sequences, il faut effectuer l'inversion ou bien la complémentation pour etre sous forme FASTA??? faux ou vrai?? |
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#6 |
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Membre éprouvé
![]() Inscription : avril 2007 Messages : 749 ![]() |
On a pas à se plonger dans tes cours pour savoir ce qu'est "l'origine du séquence " ou une forme "FASTA".
C'est à toi de formaliser ton problème informatiquement, puis ensuite si tu bloques sur un point technique on pourra t'aider. |
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#7 |
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Membre Expert
![]() Laurent R.Conseil - Consultant en systèmes d'information Inscription : mai 2012 Messages : 588 ![]() |
Exactement, je peux t'aider à résoudre un problème en Perl, ou plusieurs s'il y en a plusieurs, si besoin et dans la mesure de mes compétences, mais la dernière fois que j'ai fait de la biologie et de la génétique, c'était en 1975, je suis largué quand tu parles d'origine, et Orf et NCBI ne me parlent absolument pas. Tu ne me donnes aucun moyen de t'aider.
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Sauf mention contraire explicite, les bouts de code que je poste en réponse à une question n'ont pas forcément été testés. |
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#8 |
![]() ![]() ![]() Inscription : avril 2004 Messages : 13 809 ![]() |
Merci de changer le titre de cette discussion sous peine de fermeture de cette dernière.
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