Bonsoir a vous ,

j'ai exactement 3 jours pour pouvoir coder sur matlab un algo pour extraire les pvalues , id des probe sets et PM et MM ( une mission impossible je sais mais quoi faire face à la tyrannie de certains professeurs). mon probleme est que je n'arrive pas a faire marcher la fonction basique " celintensityread" pour pouvoir recuperer les id et l'intensite du signal (ca commence bien ) donc j'ai fait autre chose . voila mon code :


Code : Sélectionner tout - Visualiser dans une fenêtre à part
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%charger le fichier dans le repertoire et lecture du fichier cdf
libDir= 'C:\Users\user\Desktop\Puces tp\';
'cdfStruct = affyread('HG-U133A.CDF',libDir);
 
%chargement et lecture du fichier cel
 
demoDataDir='C:\Users\user\Desktop\Puces tp\';
'nom_file=uigetfile;
celStruct = affyread(fullfile(demoDataDir,nom_file));
 
%normalisation et calcul de lexpression de ce fichier cel
Expression =affyrma(nom_file, 'HG-U133A.CDF');
 
%création d'une matrice contennat les informations relatives a ces fichiers
Data=Expression.(':')(':');
%matrice contenant tous les genes du fichier cell
Genes=Expression.RowNames;
je n'arrive pas a parcourir la matrice gene pour recuperer les pvalues vous pourriez m'aider s'il vous plait ?

merci d'avance de votre aide