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  1. #1
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    Par défaut recuperer le meilleur hit d'un blast

    Bonjour,
    J'ai plusieurs fichiers blast et j'aimerais savoir comment peut-on garder les informations essentielles, dans mon cas cela correspondrait a ne conserver que les informations du meilleur hit. Quelqu'un pourrait il m'aider? Merci

  2. #2
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    Par défaut

    Si je me souviens bien, les hits sont déjà classés en ordre décroissant de score/e value, il te suffit donc de ne prendre que le premier résultat. Regarde le module Bio::SearchIO si tu n'as pas encore de parser BLAST
    Nous les geeks, c'est pas qu'on a une case en moins, c'est juste qu'on compte à partir de zéro.
    Plus les choses changent, plus elles restent les mêmes

  3. #3
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    Par défaut re

    ok merci

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