Bonjour,
J'ai plusieurs fichiers blast et j'aimerais savoir comment peut-on garder les informations essentielles, dans mon cas cela correspondrait a ne conserver que les informations du meilleur hit. Quelqu'un pourrait il m'aider? Merci
Inscrivez-vous gratuitement
pour pouvoir participer, suivre les réponses en temps réel, voter pour les messages, poser vos propres questions et recevoir la newsletter
recuperer le meilleur hit d'un blast
Bonjour,
J'ai plusieurs fichiers blast et j'aimerais savoir comment peut-on garder les informations essentielles, dans mon cas cela correspondrait a ne conserver que les informations du meilleur hit. Quelqu'un pourrait il m'aider? Merci
Si je me souviens bien, les hits sont déjà classés en ordre décroissant de score/e value, il te suffit donc de ne prendre que le premier résultat. Regarde le module Bio::SearchIO si tu n'as pas encore de parser BLAST
Nous les geeks, c'est pas qu'on a une case en moins, c'est juste qu'on compte à partir de zéro.
Plus les choses changent, plus elles restent les mêmes
re
ok merci
Vous avez un bloqueur de publicités installé.
Le Club Developpez.com n'affiche que des publicités IT, discrètes et non intrusives.
Afin que nous puissions continuer à vous fournir gratuitement du contenu de qualité, merci de nous soutenir en désactivant votre bloqueur de publicités sur Developpez.com.
Répondre avec citation
Partager