Précédent   Forum du club des développeurs et IT Pro > Autres langages > Perl > Bioinformatique
Bioinformatique Toutes vos questions sur les scripts Perl associés à la bioinformatique, modules bioperl, projets bioinformatiques, etc ... Avant de poster, veuillez consulter les cours Perl et les critiques de livres.
Partagez cette discussion sur d'autres réseaux sociaux : Viadeo Twitter Google Facebook Digg Delicious MySpace Yahoo
Réponse
 
Outils de la discussion
Publicité
'
Vieux 31/07/2012, 16h34   #1
angioedema
Nouveau Membre du Club
 
Étudiant
Inscription : novembre 2009
Messages : 102
Détails du profil
Informations personnelles :
Âge : 23

Informations professionnelles :
Activité : Étudiant

Informations forums :
Inscription : novembre 2009
Messages : 102
Points : 36
Points : 36
Par défaut BatchPrimer3 : input problem

Bonsoir,

J'ai posté un message similaire dans la partie web mais je ne trouve aucune réponse ... J'ai ddl batchprimer3 et je l'ai mis sur le serveur. Malheureusement lors de l'appel le script n'est pas exécuter (à cause du cgi certainement) et le code s'affiche dans la page ...
Du coup devant intégrer l'outil dans Galaxy et ayant quelques soucis d'affinité entre Galaxy et l'HTML, je me suis lancée dans une belle aventure : recoder batchprimer3 pour qu'il fasse la même chose mais sans CGI ...
D'où mon problème, à l'appel du primer_core et après affichage de la première case de mon tableau de résultat j'obtiens "Unrecognized base in input sequence" (sequence marchant dans un autre batchprimer3 et même en la remplaçant j'obtiens la même erreur). Et là je n'ai aucune idée de ce que ça peut bien être ^^'

Merci pour votre attention
angioedema est déconnecté   Envoyer un message privé Réponse avec citation 00
Vieux 01/08/2012, 15h25   #2
angioedema
Nouveau Membre du Club
 
Étudiant
Inscription : novembre 2009
Messages : 102
Détails du profil
Informations personnelles :
Âge : 23

Informations professionnelles :
Activité : Étudiant

Informations forums :
Inscription : novembre 2009
Messages : 102
Points : 36
Points : 36
le problème venait tout simplement du fait qu'il faut nécessairement passer un id à primer core
angioedema est déconnecté   Envoyer un message privé Réponse avec citation 00
Réponse Cette discussion est résolue.
Outils de la discussion

Navigation rapide


Fuseau horaire GMT +2. Il est actuellement 09h08.


 
 
 
 
Partenaires

Hébergement Web