Discussion :

[cochrane]

Bonjour,
Je cherche à plotter un volume d'eau avec Matlab. Ma première idée est d'utiliser isosurface(x,y,z,v, isovalue) sauf qu'à la place d'avoir une seule valeur "isovalue" j'aimerai que matlab plot toutes les valeurs supérieur à un certain seuil. Connaitriez vous une commande pour faire celà?

Sinon, avez-vous d'autres idées??

Merci d'avance!
Thibault

[Jean Dumoncel]

Bonjour,

il te suffit de faire une isosurface pour chaque isolaveur, non?

Sinon, tu peux aussi regarder la fonction slice. Pour les autres méthodes, tout dépend de ce que tu veux visualiser (tu peux regarder la-dedans : 3-D Visualization)

[cochrane]

et une fois que j'aurais fait une isosurface pour chaque valeur, pourrais-je les fusionner?

[Jean Dumoncel]

Qu'entends-tu par "les fusionner"?

[cochrane]

Mon but est de modéliser un "volume" (un espece de "blob") qui correspond à une eau dont la salinité est supérieur à x (donc entre x et l'infini). Si je passe par isosurface, j'aurai seulement les points d'une valeur de salinité, si je les fait toutes (ce qui va me prendre du temps mais c'est pas trop grave), il faudra que je les fusionnent. N'y a t'il pas une fonction qui fasse comme isosurface mais en lieu et place d'une isovalue, j'aurais une valeur min???

[Jean Dumoncel]

Désolé mais je n'a pas bien compris ce que tu cherches à visualiser... Aurais-tu une image qui ressemble à ce que tu souhaites?

Tu parles de volume, tu veux faire du rendu volumique? avec des effets de transparences? tu veux visualiser une surface?

[cochrane]

Je cherche à créer un volume d'eau, une veine d'eau. Typiquement, quelque chose du genre de la figure 1 (sans les cones et les lignes).

http://www.control.isy.liu.se/studen...4/example.html

[Jean Dumoncel]

Ok, sur cette figure, a priori il n'y a qu'une seule isosurface pour la surface rouge. As-tu essayé avec une seule isosurface?

En fait c'est difficile de t'orienter sans savoir ce que contiennent tes données. Pourrais-tu nous fournir un échantillons représentatif de tes données?

[ol9245]

Je cherche à créer un volume d'eau, une veine d'eau. Typiquement, quelque chose du genre de la figure 1 (sans les cones et les lignes).

http://www.control.isy.liu.se/studen...4/example.html

L'exemple que tu as montré se plote à partir d'une matrice régulière 3D. Par exemple si tu as une matrice qui te donne Salinite[x,y,z].

Chezrche dans la doc thématique dans le chapitre "volume visualization"

[cochrane]

@Magelan : Oui j'ai essayé en utilisant isosurface avec une valeur de 37 de salinité, mais ce que j'aimerais c'est avoir tous les points de la salinité est supérieur ou égale à 37.

Pour mes donnéeselle se présente sous la forme de fichier netcdf que matlab sait très bien lire et j'obtiens 4 variables : X <38x16 single>, Y <38x16 single>, Z<46x1 single> et Salinité <38x16x46 single>. En fait il faut imaginer une carte rectangulaire ou X et Y donnerai les coordonnées de chacun des points de cette carte. Z donne chaque niveau vertical et Salinité donne en chaque point
de chaque niveau la salinité.
ex: X= 1.1 2.02 Y = 2.04 2.01 Z= 3.04 Salinité= 36.4 37.2
1 2.0 1 1.01 12.28 34.5 0

(salinité=0 pour les points sur la terre)

Pour simplifier la chose, j'ai créé X' <1x16 single> et Y'<38x1 single> qui représente la valeur moyenne des X et Y. Car ma grille n'est pas régulière (la terre n'est pas plate... dommage...). J'obtiens de très mince écarts et je règlerai ça plus tard.

En tout cas avec isosurface(X',Y',Z,Salinité,37), j'obtiens bien ce que je veux, mais seulement pour la valeur 37...

@ol9245 : Bonjour à toi, alors comme tu peux le voir au dessus j'ai une matrice salinité qui est fonction de x,y,z mais implicitement.
La doc "volume visualization" je crois que je la connais par coeur maintenant et je n'ai pas trouvé ce que je cherchais (je n'ai pas dit que ça n'y était pas!).
Si tu as une idée de comment je pourrai faire...

Encore merci beaucoup!

[Jean Dumoncel]

Tu cherches à visualiser les voxels de ta structure, et matlab n'est pas l'outil le plus performant pour cela, voilà pourquoi il n'existe pas de fonction qui répondent directement à tes besoin.

Mais ton volume n'étant pas très volumineux, donc tu devrais pouvoir t'en sortir.
isosurface comme son nom l'indique extrait une surface, donc ce n'est pas adapté dans ton cas.

Regarde sur le fex les exemples et contributions qui pourraient être utilisés :
http://www.mathworks.com/matlabcentr...ge/?term=voxel

D'autres mots clés pour la recherche : viewer 3D rendering ...

Notamment peut-être cette fonction :
Voxel Image?

Une méthode pourrait être de :
interpoler tes données sur une grille régulière (ce que tu sembles avoir fait).
segmenter la zone que tu veux visualiser : attribuer 1 aux voxels supérieurs à un seuil de salinité et 0 aux autres
visualiser ces voxels en utilisant Voxel Image.

[cochrane]

Ce que tu m'indique à l'air très pertinent pour ce que je cherche à faire. Je regarde et te dis si ça a fonctionné!

[ol9245]

@ol9245 : Bonjour à toi, alors comme tu peux le voir au dessus j'ai une matrice salinité qui est fonction de x,y,z mais implicitement.
La doc "volume visualization" je crois que je la connais par coeur maintenant et je n'ai pas trouvé ce que je cherchais (je n'ai pas dit que ça n'y était pas!).
Si tu as une idée de comment je pourrai faire...

fonction isosurface(x,y,z,v,0), en utilisant la fonction patch.
c'est expliqué ici : http://www.mathworks.fr/help/techdoc...e/f5-3653.html

[cochrane]

J'utilise ceci mais je ne comprend pas à quoi sert la fonction patch... En fesant une simple isosurface, j'obtiens (presque) ce que je veux. J'aimerais une "isosurface" qui me trace le volume compris entre deux isovalue. Mais je ne trouve pas...

[Jean Dumoncel]

isosurface permet de calculer l'isosurface, et patch permet de l'afficher.

Tu pourrais nous montrer le résultat du tracé d'une isosurface?