installation du module Boulder::Blast [Résolu]

[Jasmine80]

Bonjour à tous,


Pourriez-vous me dire dans quel repository trouvez-vous le module Boulder ... je voudrais l'installer via ppm mais je ne le trouve plus dans mes 2 repositories de bioperl

bioperl1
http://bioperl.org/DIST/package.xml

bioperl2
http://bioperl.org/DIST/RC/

d'avance merci,

[djibril]

Fais cpan
install Boulder.

[Jasmine80]

Bonjour Djibril et merci pour ton aide.

J'ai un message comme quoi ce module n'est pas disponible sur cpan



EDIT : pq le répertoire où s'est installé Perl par défaut s'appelle-t'il Perl164?

[djibril]

Par ce que tu doit être sous une machine 64 bits.

[djibril]

Code :

1
2
cpan
install LDS/Boulder-1.30.tar.gz

[Jasmine80]

... ça ne fonctionne pas


http://imageshack.us/f/607/boulder.png/

(on peut agrandir l'image en double cliquant dessus)


... le message est claire il semblerait manquer un compileur C, mais il n'arrive pas à installer Dmake et MinGW via ppm

... un problème de proxy


merci

[Jasmine80]

Comment installer 'dmake' et 'MinGW gcc compiler' via ppm ... c'est ce que le message d'erreur me suggère.

Merci.

[Philou67430]

Tu as regardé ce paragraphe : Installing a make utility and C compiler on 64-bit Windows ?

[Jasmine80]

Merci Philou, c'est ce dont j'avais besoin :

Le site renseigné semble avoir été mis à jour car la capture d'écran ne correspond plus au lien, il y a maintenant 3 exécutables pouvant être téléchargés :

PSDK-amd64.exe 1.3 MB Download
PSDK-ia64.exe 1.4 MB Download
PSDK-x86.exe 1.3 MB Download



Lequel dois-je installer? En as-tu une idée?


Merci beaucoup.

[Beniou]

Bonjour,

La version dépend de ton processeur :
- PSDK-amd64.exe => processeur intel ou amd 64 bits
- PSDK-ia64.exe => processeur itanium 64 bits
- PSDK-x86.exe => version 32 bits

Si tu disposes d'un processeur 64 bits, je dirais qu'il y a 99% de chance que ce soit le premier que tu dois prendre, à savoir le PSDK-amd64.exe.

[Philou67430]

Je dirais pareil que Beniou

[Jasmine80]

Oui, merci, c'est un : Intel(R) Core(TM) i7-2600 CPU @ 3.40 GHz

[Jasmine80]

L'installation s'est bien passée

Pourriez-vous m'aider pour cette étape, s'il vous plait? (provient du lien donné par Philou)

Use the SetEnv.cmd script to set the PATH, LIB, and INCLUDE environment variables to the correct value for building ActivePerl extensions with this command:

"C:\Program Files\Microsoft Platform SDK\SetEnv.Cmd" /XP64 /RETAIL

1) où trouver le script SetEnv.cmd
2) quelles sont les valeurs correctes à attribuer aux variables d'environnement : PATH, LIB, et INCLUDE
3) la commande renseignée semble incomplète, c'est le chemin vers un répertoire ... pourriez-vous m'éclairer


Merci beaucoup pour votre aide à tous les 2

[Lolo78]

Je n'utilise pas Perl sous Windows, mais la commande à utiliser semble figurer dans ta question:

"C:\Program Files\Microsoft Platform SDK\SetEnv.Cmd" /XP64 /RETAIL

[djibril]

Tout est pourtant expliqué dans cet article : http://djibril.developpez.com/tutori...ation-modules/.

[Jasmine80]

Merci Djibril,

j'ai rajouté le repository : bribes : http://www.bribes.org/perl/ppm64/

Donc en résumé :
0) je lis le README du module Boulder::Blast pour voir si il est compatible sur Windows 7
1) j'installe Microsoft Visual C++ 2010 Express.
2) je rajoute C:\Program Files (x86)\Microsoft Visual Studio 10.0\VC\bin dans PATH
3) j'installe le module PPM::Make


merci et bon weekend

[Jasmine80]

Tout s'est bien passé jusque là

la suite :

téléchargez le module sur le site du CPAN et décompressez-le ; OK
cd RepertoireModule ; OK
perl Makefile.PL ; OK
nmake (ou dmake) ; OK
nmake test (ou dmake test) ; KO
nmake install (ou dmake install).

... j'ai une erreur fatale




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Avez-vous des conseils?

merci pour votre aide et merci beaucoup à Djibril pour ses tutoriels

[djibril]

fais ceci :

Code :

1
2
cpan
install Boulder

et si ça ne fonctionne pas, force install Boulder

[Beniou]

Juste comme ça : ca ne pourrait pas venir d'un module apparemment manquant pour les tests ?

Can't locate DB_File.pm in @INC...

[Jasmine80]

Envoyé par djibril

Code :

ça a fonctionné, merci pour votre aide à tous