add organism BLAST

[mycaweb]

Bonjour,
j'utilise un patron de script PERL utilisant le module RemoteBlast pour lancer un BLAST au NCBI et non en local.
Ce patron permet de Blaster sur l'organisme 'Toto_A' gràce à la ligne

Code :

$Bio::Tools::Run::RemoteBlast::HEADER{'ENTREZ_QUERY'} = 'txidToto_A [ORGN]'

, mais je ne vois pas comment modifier ce script pour pouvoir blaster à la fois sur Toto_A et sur Toto_B !
(j'aimerai rajouter un organisme en somme).

Merci beaucoup

Myca

[Gardyen]

question probablement bête mais as-tu utilisé AND ?

Code :

1
2
 
$Bio::Tools::Run::RemoteBlast::HEADER{'ENTREZ_QUERY'} = 'txidToto_A [ORGN] AND txidToto_B [ORGN]'