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Bioinformatique Perl Discussion :

Interprétation et Modélisation des réseaux génique


Sujet :

Bioinformatique Perl

  1. #1
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    Par défaut Interprétation et Modélisation des réseaux génique
    Bonjour,

    Je cherche un interpréteur des résultats de modélisation et de simulation des réseaux de régulation génétique, ou des idées pour pouvoir les interpréter.
    Aussi, y a t-il d'autres outils de modélisation des réseaux génétique ( je connais GNA ).

    je serai reconnaissante pour votre aide

  2. #2
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    Dans le cadre modélisation il y a Cytoscape qui permet notamment d’explorer les interactions d’un groupe de gènes, d’interpréter des résultats de microarray ou de modéliser des régulations génétiques ou métaboliques.( voir http://www.cytoscape.org/ )
    il existe aussi COPASI (Complexe Pathway Simulator) mnt opensource qui a la capacité d'ajuster automatiquement les paramètres du modèle à reproduire les résultats expérimentaux, ce qui contribue à justifier la validité du modèle choisi.


    bon courage

  3. #3
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    D'un point de vue un peu plus personnel et en l'ayant fait en stage (je cherchais la même chose que toi), prend cytoscape il est plus facile d'utilisation sur pas mal de points, il est développé par une grande école d'Angleterre (que je ne pourrais pas citer faute de problèmes de mémoire), et les tutos une fois trouvés sont assez bien fait (comparé aux autres).

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