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  1. #1
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    Par défaut software pour un stage en bioinformatique à Melbourne

    Bonjour,

    J'appelle Florian Brunet , étudiant en école d'ingénieur à Limoges.
    J'aimerais partir à Melbourne en Australie pour faire un stage en développement, en passant par l'amicale des anciens élèves de mon ancien lycée "Saint Gabriel" je retrouve un ancien élève qui aujourd'hui travaille comme chercheur à l'université de Monash à Melbourne. (Il travaille dans le domaine de la recherche medicale (recherche fondamentale sur l'inflammation et ses debouchers sur certains cancers)
    ...
    1er email "si tu cherches quelquechose qui touche a la biologie (bio-informatique), la je peux peut etre t'aider à faire un stage. J'ai moi-meme un projet qui tourne autour de bio-info.. "


    Voila .. alors mon rêve c 'est de travailler là bas cette été comme stagiaire.

    Je lui ai envoyé un email et voila une partie de ça réponse :

    Je m'excuse du delais de reponse - j'ai ete tres pris ces dernieres semaines.
    Malheureusement, etant donne que c'est pour un stage de debut d'etudes je pense que l'idee de travailler sur mon projet de bioinfo est sans doute trop ambitieuse - je ne pourrais pas assez te superviser (c'est en dehors de mes competences de biologiste) et mon travail implique des modelisations statistiques qui sont bien plus de l'ordre des maths appliquees (Matlab) que de la programmation.
    Je suis un travailleur et passionné de programmation, j'utilise MatLab j'ai vraiment envie de faire ce stage avec lui , donc j'aimerai l'épaté.. c 'est à dire lui montré ce que je suis capable de faire un bon programme pour la bio-info.


    Donc qu'est ce que je peux faire pour lui donné envie de me prendre comme stagiaire ? Qu'est ce que je peux faire comme programme intéressant à un bon niveau ? avec MatLab 2011 par exemple ?



    Merci pour vos réponses.


    Amicalement

    Lionceau,

  2. #2
    Dut
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    A noter que MATLAB dispose de 2 toolbox dédiées :


    Tu peux peut être parcourir leur documentation pour trouver des idées...
    Sur mon blog : Sortie du livre « Accelerating MATLAB Performance »

    Ma page personnelle avec mes contributions MATLAB (R2011b/R2014b - Windows, Linux et Mac) et Hardware

    « J'étais le meilleur ami que le vieux Jim avait au monde. Il fallait choisir. J'ai réfléchi un moment, puis je me suis dit : "Tant pis ! J'irai en enfer" » (Saint Huck)

  3. #3
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    Ou sinon carrément basculer sous R...

  4. #4
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    Par défaut

    sous R.. ???
    Mathgon qu'est ce que tu veux dire ?


    Merci pour votre aide,

    Lionceau,

  5. #5
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    Par défaut

    Dut -> est ce que tu sais où je pourrais trouver des exemple d'application pour la bio informatique ???

    Merci pour ton aide,

    Lionceau,

  6. #6
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    Par défaut

    Bonjour,

    J'ai trouvé ici des sources qui pourrai bien m'aider ici :

    http://www.mathworks.fr/computationa...ogy/demos.html
    http://www.mathworks.fr/biotech-phar...cal/demos.html


    http://perl.developpez.com/telecharg...ioinformatique

    Avez vous déjà utilisé MatLab pour la Bio-Informatique ?
    Si c 'est le cas , quel sont vos expériences ? conseils ? Quel type de logiciel développez vous actuellement ? ... ?


    Lionceau,

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