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14/02/2012, 15h56
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Nouveau Membre du Club
 Inscription : janvier 2010 Messages : 200  |
Manipulation sequence fichier fasta
Bonjour à tous,
J'ai un problème avec la manipulation d'un fichier fasta. Il ressemble à cela : >pi1 ATGCGTGAAATGCAT >pi2 TGCCCTGATAGGGACCAGTAGAC >pi3 ATGCGTGAAATGCATA >pi4 TGCATGACTA >pi5 ATGCGTGAAATGCATAT J'ai mis en gras les pi ayant la même séquence, et je souhaite garder seulement la plus longue sequence, donc mon nouveau fichier : >pi5 ATGCGTGAAATGCATAT >pi2 TGCCCTGATAGGGACCAGTAGAC >pi4 TGCATGACTA Je n'ai aucune idée de comment faire ce genre de chose, quelqu'un pourrait m'aider ? Merci d'avance. |
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15/02/2012, 21h21
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#2 |
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Membre émérite
  Assistant recherche bioinformatique Inscription : novembre 2007 Messages : 824 |
Hello,
Quelles sont les conditions exactes pour que le pi soit et ne soit pas choisi ? (longueur minimum en commun par exemple) Z. |
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