Précédent   Forum des professionnels en informatique > Systèmes > Linux > Applications
Applications Questions sur l'utilisation d'applications, du shell, et des interfaces graphiques (KDE, Gnome, XFCE... )
Partagez cette discussion sur d'autres réseaux sociaux : Viadeo Twitter Google Facebook Digg Delicious MySpace Yahoo
Réponse Proposer ce sujet en actualité
 
Outils de la discussion
Publicité
'
Vieux 03/01/2012, 12h59   #1
Invité de passage
 
Femme
Étudiant
Inscription : janvier 2012
Messages : 4
Détails du profil
Informations personnelles :
Sexe : Femme
Localisation : France

Informations professionnelles :
Activité : Étudiant
Secteur : Industrie

Informations forums :
Inscription : janvier 2012
Messages : 4
Points : 2
Points : 2
Par défaut probleme avec ma commande recon-all

Bonjour,

J'ai installé le logiciel Freesurfer sur ubuntu 10.10 pour le tester j'ai besoin d'exécuter la commande :

Code :
recon-all -i invol1 -i invol2 -subjid your_subject_name
j'ai suivie les étapes indiqués dans le lien:https://surfer.nmr.mgh.harvard.edu/f...Reconstruction
il me renvoie le message d'erreur suivant:

Code :
1
2
3
4
5
6
7
8
9
10
11
12
13
14
15
16
17
18
19
20
21
22
23
24
25
26
27
28
29
30
nass:/usr/local/freesurfer/subjects/bert/mri> mri_convert orig/anon2/IM-0001-383975432-0001_an orig/001.mgz
mri_convert orig/anon2/IM-0001-383975432-0001_an orig/001.mgz
$Id: mri_convert.c,v 1.179.2.2 2011/05/16 20:53:47 greve Exp $
reading from orig/anon2/IM-0001-383975432-0001_an...
Starting DICOMRead2()
dcmfile = orig/anon2/IM-0001-383975432-0001_an
dcmdir = orig/anon2
Ref Series No = 601
Found 162 files, checking for dicoms
Found 160 dicom files in series.
First Sorting
Computing Slice Direction
Vs: -0.999329 -0.0354691 -0.00823402
Vs: -0.999337 -0.0354693 -0.00823409
Second Sorting
Counting frames
nframes = 1
nslices = 160
ndcmfiles = 160
PE Dir = ROW (dicom read)
TransferSyntaxUID: --1.2.840.10008.1.2.1--
jpegUID: --1.2.840.10008.1.2.4--
Loading pixel data
TR=9.90, TE=4.60, TI=0.00, flip angle=8.00
i_ras = (0.03547, -0.999371, 6.83771e-13)
j_ras = (-0.00822892, -0.000292064, -0.999966)
k_ras = (0.999337, 0.0354693, -0.00823409)
writing to orig/001.mgz...
mghWrite(orig/001.mgz, -1): could not open file
ERROR: failure writing orig/001.mgz
si quelqu'un sait de quoi il s'agit merci de me donner un coup de main .
dihinass est déconnecté   Envoyer un message privé Réponse avec citation 00
Vieux 03/01/2012, 13h32   #2
Expert Confirmé Sénior
 
Avatar de frp31
 
Homme francois
Ingénieur systèmes et réseaux
Inscription : juillet 2006
Messages : 3 538
Détails du profil
Informations personnelles :
Nom : Homme francois
Âge : 35
Localisation : France, Haute Garonne (Midi Pyrénées)

Informations professionnelles :
Activité : Ingénieur systèmes et réseaux
Secteur : Aéronautique - Marine - Espace - Armement

Informations forums :
Inscription : juillet 2006
Messages : 3 538
Points : 7 754
Points : 7 754
Code :
1
2
3
writing to orig/001.mgz...
mghWrite(orig/001.mgz, -1): could not open file
ERROR: failure writing orig/001.mgz
ça pourraît être un problème de droits sur orig/001.mgz
ou sur le répertoire orig
ou encore orig qui n'existe pas
ou encore un problème de droits sur le repertoire courant qui empeche la création du repertoir orig..

déjà pour commencer l'analyse du probleme
frp31 est déconnecté   Envoyer un message privé Réponse avec citation 00
Réponse Proposer ce sujet en actualité
Outils de la discussion



Fuseau horaire GMT +2. Il est actuellement 06h12.


 
 
 
 
Partenaires

Hébergement Web