PROC MIXED : Différence LSMEANS, Estimate, Contrast [Résolu]

[cladoo]

Bonjour,

je suis en train d'essayer de me familiariser avec la PROC Mixed (cf mes autres posts), et je vois qu'on peut réaliser dans cette procédure de l'inférence via les instructions LSMEANS, Estimate, Contrast.

Concrètement, quelle est la différence entre ces 3 options et dans quels cas les utilise-t-on ? (la doc SAS étant trop théorique pour moi j'ai un peu de mal là...)

Merci

[olivier.decourt]

Pour faire court :
* LSMEANS te donne les moyennes ajustées (= reconstruites à partir des coefficients du modèle) ainsi que leurs différences 2 à 2 ou par rapport à un contrôle. Tu peux indiquer des ajustements de multiplicité. Si tu as des effets croisés, tu peux fixer un des deux éléments avec SLICE.
* CONTRAST et ESTIMATE permettent de faire des combinaisons de coefficients du modèle de manière plus libre et générale. On peut reproduire les résultats de LSMEANS (mais pas les ajustements de multiplicité)... mais en se faisant quand même beaucoup ch... (cf nos discussions sur tes autres posts). Ces instructions permettent de tester une linéarité par exemple (est-ce que les variations moyennes de Y sont linéaires avec l'augmentation de la dose, qui a été introduite comme un facteur qualitatif ?).

La différence entre CONTRAST et ESTIMATE ne m'a jamais semblé très nette si ce n'est que CONTRAST ne fournit que la p-value d'un test de nullité, tandis qu'ESTIMATE donne l'estimation de la combinaison linéaire et la p-value.
Les combinaisons linéaires de coefficients peuvent être plus complexes avec CONTRAST qu'avec ESTIMATE. Mais bon, en général, les deux sont interchangeables pour les applications de la vie courante.

[cladoo]

Bonjour et merci Olivier pour votre retour efficace.

Donc pour faire simple, je peux commencer de manière 'globale' avec LSMEANS puis affiner en fonction de mes hypothèses avec ESTIMATE ?

Petite question : est-ce que les 3 méthodes testent la même chose ? je veux dire, dans les 3 cas on part bien des coefficients estimés par le modèle non ?

[Manoutz]

les coefficients estimes correspondant aux parametres apparaissent dans la partie "solution pour effets fixes" de l'output. On peut parfois directement repondre a la problematique (faut voir ce qui est demande) en utilisant l'option solution, l'ordnnancement des categories et en jonglant le noint.

Les trois methodes ont des fonctionnalites differentes, cf le post d'Olivier (d'ailleurs il me semble que ce n'est pas necessairement du 2 a 2 suivant l'ajustement choisi).

Estimate et contrast font sensiblement la meme chose, estimate fournit un peu plus d'infos. Contrairement au LSMEANS et l'option solution, on va pouvoir modeler des inferences selon notre propre souhait. Par exemple, si tu veux tester si la moyenne du groupe 1 a la viste 3 egale celle du groupe 2 a la visite1, c'est possible. Le gros plus du contrast, c'est que tu peux tester des hypotheses simultanement. On l'utilise tres souvent pour tester des egalites du style: "je veux savoir si les moyennes des trois groupes sont egales". On va tester si moyenne groupe1=groupe2 ET moyenne groupe 1=groupe 3. Ce n'est pas la meme chose que faire deux tests independemment.

[cladoo]

Merci à vous 2!

Pour ceux que ça peut intéresser, je viens de décortiquer cet article et il est vraiment très clair (avec des exemples), il m'a beaucoup aidé à comprendre la différence entre les 3 méthodes.

http://www.uky.edu/ComputingCenter/S...ion/mixed1.htm